近年来，随着边滩湿地的围垦、河口区大型工程的建设和向海洋排污量的加大，加上人类活动对长江口及其邻近水域生态系统产生不同程度的影响，河口生态系统承受着巨大压力，生态健康面临严重威胁。为了了解长江口及其邻近水域大型底栖动物的多样性，本文从长江口及其邻近水域潮间带和潮下带两方面进行了研究。主要包括以下内容：　　1．长江口及其邻近水域潮间带大型底栖动物多样性的研究　　本研究调查了2012年9月、10月、11月和12月四个月份10个站点的长江口及其邻近水域滩涂底栖动物种类组成与数量分布，并用Shannon-Wiener多样性指数（H′）、Pielous种类均匀度（J）、种类丰度（d）和Berger-Parker优势度指数（Y）等4个指标参数分析了物种多样性。结果表明，调查所采获的底栖动物种类共有5门37种，主要由甲壳动物、软体动物和多毛类动物等组成。长江口及其邻近水域滩涂四个月的平均生物量13.33 g/m2，平均丰度为50.06 ind./m2。四个月份中，多样性指数（H′）的范围值为1.35～1.89，种类均匀度（J）的范围值为0.40～0.54，种类丰度（d）范围值达到4.64～5.16。四个月份各类群动物组成中，生物量及丰度均以软体动物居首位。应用等级聚类分析和非度量多维标度排序分析发现，9月、10月为一组，11月、12月为一组。ABC曲线结果显示长江口及其邻近水域滩涂底栖动物11月、12月受到严重干扰，9月和10月也受到了一定程度的扰动。　　调查了2013年1月、5月、8月、11月四个月份10个站点的长江口及其邻近水域滩涂底栖动物种类组成与数量分布，结果表明，调查所采获的底栖动物种类共有底栖动物4门38种，其中节肢动物17种，软体动物13种,环节动物7种，鱼类1种。1月种数为19种，5月底栖动物共有27种，8月底栖生物共13种，11月底栖动物共10种。调查水域滩涂获取底栖动物生物量和栖息密度四个季度平均值分别为16.29g/m2和36.22个/m2。优势种有无齿螳臂相手蟹、红螯螳臂相手蟹、粗糙滨螺、河蚬四种。四个季度多样性指数（H′）平均值为2.09。　　2.长江口潮下带大型底栖动物的年度特征变化　　通过2013年和2014年长江口及其邻近水域开展的8个航次124个站点的海洋生物调查，并用Shannon-Wiener多样性指数（H′）、Pielous种类均匀度（J）、种类丰度（D）和Berger-Parker优势度指数（I）等4个指标参数分析了物种多样性。　　结合2012年的调查结果，从同一年不同季节和不同年份两方面对该水域大型底栖动物的种类组成、生物量、丰度、优势种、特征种及多样性进行了研究，结果显示，2013年共采获大型底栖动物49种，2014年40种，每年不同季节种类更替明显且物种总数逐年减少。2013年丰度和生物量最高分别出现在春季和秋季，2014年分别为冬季和夏季，不同年份不同季节的生物量和丰度明显不同。不同年份的特征种均以甲壳动物类群为主，鱼类优势种增多。2013年的秋季和2014年的春季相对于同年度其他季节有更高的多样性，年度变化上多样性指数整体增高。应用等级聚类分析和非度量多维标度排序分析发现2013年夏秋冬聚为1组，春季为1组；2014年春夏秋聚为1组，冬季为1组。ABC曲线结果显示潮下带底栖动物群落在2013年四季受到中度干扰，2014年春夏秋受干扰不明显，冬季受到中等程度以上的干扰。整体上有逐年干扰减轻的趋势。