基于基因芯片技术的肝癌糖类相关基因表达谱研究

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研究背景:糖链及其缀合物不仅参与生命活动的基本生理生化过程,而且在肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用。肿瘤细胞中的糖链与正常细胞相比有明显变化,包括表达增多,减少或出现新的结构等。糖链的合成没有模板,而是通过一系列定位有序的糖基转移酶,糖苷酶以及磺基转移酶的作用完成的,这些酶的表达差异将直接导致糖链结构的变化。因此,从这些糖类相关基因入手可以研究它们如何调控糖链的合成,寻找癌症相关糖基因,为筛选抗癌药物提供靶分子,为癌症的早期诊断和防治提供有效方法。目的:运用基因芯片技术为检测手段,筛选在肝癌中差异表达的糖类相关基因,作为肝癌检测的标记物,为肝癌早期诊断和抗肝癌药物提供靶分子,并为肝癌及其他肿瘤的研究建立平台。方法:本实验以正常肝细胞系CL(chang’s liver)和肝癌细胞系7721,以及正常人血液和肝癌病人血液为研究对象,利用本实验室自主研发的糖类相关基因芯片(其中包括糖基转移酶130个,糖苷酶12个,磺基转移酶48个,质控点20个),系统地研究肝癌样本及正常样本中糖类相关基因发生的变化,筛选肝癌中异常表达的糖类相关基因,并用荧光定量PCR技术加以验证。结果:用糖类相关基因芯片对正常肝细胞系CL(chang’s liver)和肝癌细胞系7721进行比较研究,筛选出了差异表达的糖类相关基因38个,其中上调基因19个,下调基因19个。又对肝癌病人血液和正常人血液样本进行了研究,筛选出了上调基因15个,下调基因13个。细胞样本和血液样本中上调基因重合的有7个,下调基因重合的有5个。从中挑选出了四个表达差异较大的基因,上调基因两个Alg10和Galnt11,下调基因两个Hmcs,Galnt12。用荧光定量PCR技术对这四个基因的表达水平进行验证,其结果与芯片结果呈现出一致性。结论:利用糖类相关基因芯片与荧光定量PCR等技术系统的研究了肝癌糖类相关基因表达谱,筛选出12个差异表达的基因,为今后肝癌的深入研究以及临床诊断和基因治疗创造了条件。该试验中成功设计和制备出的糖类相关基因芯片,为其它肿瘤与相关糖类基因的研究建立了平台。
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