目前，极端微生物已成为国际研究的热门领域。盐碱湖是一类典型的极端环境，在我国尤其是内蒙古地区有着大量的分布。然而，到目前为止，我国对盐碱湖微生物的研究还不足，特别是对内蒙古地区盐碱湖微生物的研究很少。本研究采用纯培养和构建16S rDNA文库相结合的方法，首次对内蒙古浑善达克地区桑根达来、达各淖和扎格斯台淖三个盐碱湖的水样进行了细菌群落结构及多样性分析，将为内蒙古地区盐碱湖微生物的深入研究奠定基础。　　基于纯培养方法的研究结果显示，从桑根达来盐碱湖主要分离得到三类细菌：Gammaproteobacteria、Bacilli和Actinobacteria，前两者的比例相当（46.2％），是此环境优势类群，其中两株菌S03和S09的相似度很低，分别为72%和88.7%，可能是γ-变形菌纲的两株新菌；从达各淖盐碱湖分离得到两个类群：Gammaproteobacteria和Bacilli，前者占80%，是主要的类群，其中一株芽孢杆菌目细菌相似度为84.3%，可能是一株新菌；扎格斯台淖盐碱湖分离情况与达各淖基本一致，主要分离到Gammaproteobacteria和Bacilli两个类群，但是两者所占比例相差小，说明物种分布比较均匀，同时，此环境中也分离到了相似度为84.3%的一株芽孢杆菌目细菌，该菌是Bacilli中的优势菌。　　基于16S rDNA文库方法的研究结果显示，桑根达来盐碱湖微生物多样性指数为0.8916，不同物种分布的均匀度0.2972，物种的丰富度1.6368，Gammaproteobacteria为优势类群，该环境中微生物的物种比较单一，并且未知菌很少。达各淖盐碱湖微生物多样性指数1.9230，不同物种分布的均匀度0.4312，物种的丰富度4.5712，Cyanobacteria为主要的优势类群，是本环境独有的一类种群，占整个群落的53%，还有13%的一类未知细菌，说明本环境中存在一定的新型微生物资源。扎格斯台淖盐碱湖微生物多样性指数3.7281，不同物种分布的均匀度0.6201，物种的丰富度12.3442，说明该环境中微生物有很高的物种多样性，物种丰富度极高，且分布较均匀。存在着大量的未知菌，占有很高的比例（56.6%）。