创新链是围绕一个或以上的核心主体，以创新为纽带，把具有互补性的各个链节点连接起来，通过链节点间的相互协作、相互影响，实现知识的经济化与创新系统优化的一种功能链节结构模式。它在产业、功能、空间等不同视角下形成不一样的结构。大陆部分省市通过园区、论坛、人才交流等方式，积极对台建立科技合作关系，聚集了创新链所必需的几个条件。从这些合作模式的发展趋势来看，两岸科技合作将越来越紧密，并逐步实现创新的双向流动。广东，作为承接台湾科技产业转移的领先者，虽然自主创新能力正不断提升，但与台科技合作仍处于表层阶段，创新从台湾单向流出。这样的合作关系抑制了广东自主创新能力的进一步提高，也不利于两地的长久合作。为此，本文提出建立“粤台双向创新链”的战略，旨在探讨如何把自主创新与科技合作结合起来，实现创新竞合的可持续发展。双向创新链具有双向性、竞合性和可持续性等特点，符合科技发展的客观需要，有助于提升自主创新能力、实现规模经济、巩固合作关系。基于粤台自主创新能力和科技合作的发展情况，本文建议，必须优化广东的创新环境，突出创新合作的重点，强化两地企业及产学研的合作，打造粤台双向创新链，获得双赢。