我国的农业问题一直是国家和政府关注的重点问题。但是,在过去的几年里,由于自然灾害、金融危机和外来竞争者的挑战,我国农业的发展起起伏伏。总结入世十年来以及十一五规划期间的经验教训,实现农业的稳定发展是下一阶段的重要任务。而农业的稳定发展有赖于农业企业的稳定发展。在农业企业中,发展能力和盈利能力都处于领先地位的是农业上市公司,农业上市公司的技术革新和利润提升能带动整个农业行业的企业向前发展,更进一步,可以促进我国农业发展。如何发展农业上市公司呢?关键在于通过绩效评价找到影响绩效的因素,然后通过因素的改善达到绩效的提高。因此,本研究以2006年以前在上海和深圳A股类市场上市的26家农业上市公司为研究对象,首先运用因子分析法对各个公司在“十一五”规划期间的绩效进行评价,接着从治理结构角度出发寻找影响绩效的因素,根据相关理论和实证分析得出结论,最后针对结论提出一些具体的对策建议。本文由八章组成：第一章阐述了研究的背景,说明了研究的目的和意义,罗列了研究的假说和主要内容,介绍了研究的方法和技术路线,明确了本研究存在的创新点和不足。第二章分为两个部分,第一个部分回顾与绩效评价有关的国内外文献,并总结了我国农业上市公司绩效评价的研究现状；第二部分首先界定了什么是公司治理结构,然后回顾了有关治理结构影响绩效的国内外文献。第三章介绍了实证分析的四个理论基础：资本保全理论、委托代理理论、利益相关者理论和权变理论。第四章阐述了我国农业产业和农业上市公司发展的状况,为第五章的绩效评价奠定基础。第五章和第六章为实证研究章节。其中,第五章运用因子分析法计算各个公司2006年至2010年每一年的绩效综合得分并按得分高低进行排名,得出我国农业企业绩效变动情况。第六章从治理结构角度,分析股权治理、董事会治理和高管治理与企业绩效的相关关系,并建立回归模型进行回归分析。第七章根据因子分析,得出：在我国农业上市公司中,有一半公司的绩效处于平均水平,另一半公司的绩效朝两级分化方向发展；根据回归分析,得出：股权集中有利于农业上市公司绩效的实现,国有股、董事会规模、独立董事比例以及高管薪酬均对企业绩效没有显著影响。