过去，在“不告不理”原则引导下的我国司法实践中，司法权总是以被动出击的角色呈现于公众面前，因而司法权被公认为维护法治的最后一道防线。然而，当我们满心欢喜地回首我国近几十年来司法工作所取得的巨大成就时，我们也不得不承认司法作为法治建设最后一道防线的脆弱性、被动性和滞后性。近年来，为了克服传统司法权的弊端，提高司法工作的实际效用，推进我国和谐司法的进程，最高人民法院提出了能动司法的新理念。在践行能动司法理念、创新司法方式、提高司法实效的过程中，过去长期被忽视的司法建议制度重新受到了司法实务界的重视，各级法院制定并发出的大量司法建议书为实现个案的公平正义及全社会的安定和谐发挥了巨大的作用。反观我国现行法律，对于行政诉讼中的司法建议制度的基础性概念及制度设计尚无明确规定。至于行政法学界，则将行政诉讼中的司法建议制度的研究长期处于空白阶段。基于当前有关该问题的学理研究滞后于法律实践的现状，本文试图从基本概念出发，在明确行政诉讼中的司法建议这一概念的基础上，对该问题进行全面的分析。首先，纵向梳理其发展脉络，横向与域外的英、美、法三国的相关制度进行比较分析，借鉴他国的经验和教训。其次，文章重点论述行政诉讼中的司法建议制度在我国行政审判实践中存在以及进一步发展的正当性和价值性，同时大胆引入当前法院行政庭制作和发出的有代表性的司法建议书，以典型个案的方式总结其类型、分析其现状、研究其出路。最后，借鉴个别地方法院关于行政诉讼中的司法建议工作的先进经验，进而为我国行政诉讼中的司法建议制度提供切实可行的制度设计。