城镇保障性安居工程作为我国最重要的民生政策之一,关系着千千万万中低收入家庭的生活质量。因此,城镇保障性安居工程专项资金作为财政重大支出的重要组成部分,其合理合规的使用有利于扩大投资、促进消费、拉动产业发展。在“十二五”、“十三五”国家审计工作发展规划中,提出了审计部门不仅要对政策落实进行跟踪审计,还要在民生方面加强审计的作用。为促进民生政策更好地贯彻落实,不断规范和完善财政专项资金管理,审计部门应不断加强和改进城镇保障性安居工程专项资金跟踪审计工作。由于经济发展程度不同,国内各地区在城镇保障性安居工程跟踪审计实施过程中存在的问题也不一致。经济发展较好的地区,在法规制度、人员素质、电子技术方面更为完善;经济发展相对落后的地区,由于制度、人才、技术等方面的不足,在审计过程中面临更多的困难,如审计信息未及时公开、审计人员综合素质不高、电子信息技术未普及等。因此,本文以一个中部非省会的小城市为切入点,对审计部门在该城市实施的城镇保障性安居工程专项资金跟踪审计工作情况进行介绍,并分析该案例反映的在该城市进行跟踪审计实际遇到的困难及其原因,研究如何能在欠发达地区更好的落实国家政策。本文首先通过学习借鉴国内外研究成果,结合免疫系统理论、委托代理理论和新公共管理理论,阐述城镇保障性安居工程专项资金的相关概念,并对该专项资金跟踪审计的特点、内容、方法及难点进行了系统的描述,为下文的案例分析打下良好的理论基础;接着,以娄底市城镇保障性安居工程专项资金跟踪审计情况为例,详细介绍了该市城镇保障性安居工程专项资金的基本情况和跟踪审计的工作情况,并深入分析审计机关和审计人员在执行跟踪审计程序中存在的问题及其原因;最后针对性的提出改进城镇保障性安居工程专项资金跟踪审计的建议。