【摘 要】
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目的:鉴定宫颈鳞癌中的差异表达基因,并筛选与宫颈鳞癌病理学特征具有高度相关性的基因,在临床组织样本中,分析差异表达基因表达水平与宫颈鳞癌患者肿瘤特征的关系,初步探讨它们导致宫颈鳞癌发生发展的分子生物学基础,评估其在宫颈鳞癌诊治中的价值。方法:1.本研究采用生物信息学分析方法鉴定宫颈鳞癌中的表达差异基因,数据来源于GEO数据库包含GSE63514芯片与GSE63678芯片高通量测序数据,以及TCGA
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目的:鉴定宫颈鳞癌中的差异表达基因,并筛选与宫颈鳞癌病理学特征具有高度相关性的基因,在临床组织样本中,分析差异表达基因表达水平与宫颈鳞癌患者肿瘤特征的关系,初步探讨它们导致宫颈鳞癌发生发展的分子生物学基础,评估其在宫颈鳞癌诊治中的价值。方法:1.本研究采用生物信息学分析方法鉴定宫颈鳞癌中的表达差异基因,数据来源于GEO数据库包含GSE63514芯片与GSE63678芯片高通量测序数据,以及TCGA数据库中宫颈癌的转录组数据。使用R软件或GEPIA在线分析分析工具对其进行分析,筛选差异表达基因,分析其与宫颈癌患者年龄、肿瘤分期及患者生存之间的相关性,并分析预测的差异表达基因的靶基因,对其靶基因进行GO分析及KEGG通路富集分析。2.收集宫颈组织临床样本,分为宫颈鳞癌组及正常宫颈对照组,使用western blot方法对临床样本中差异基因蛋白表达进行检测,并统计分析差异表达基因在不同表达的情况下,临床病理特征（肿瘤分期、淋巴脉管浸润、淋巴结转移等）是否存在区别。结果:生物信息学分析:RAD51AP1是宫颈癌中的表达差异基因。RAD51AP1与E2F1的表达在宫颈癌和正常宫颈组织中具有差异性,RAD51AP1与E2F1在宫颈癌组织中的表达呈正相关;RAD51AP1与E2F1在宫颈癌患者不同年龄阶段及不同分期中的表达水平无明显差异;RAD51AP1与E2F1的共靶基因GO分析及KEGG通路富集分析发现,这些共靶基因参与的生物过程涉及了染色体分离、DNA复制、有丝分裂等;参与的细胞组分有染色质区域、着丝粒、纺锤体等;它们的分子功能涉及与DNA作用、DNA解旋酶的活性等。这些共靶基因KEGG富集通路涉及了细胞周期通路、DNA复制通路等。提示RAD51AP1与E2F1可能作为影响宫颈癌发生发展的重要因子。蛋白表达与临床病理特征相关性分析:Western-blot蛋白检测发现RAD51AP1在宫颈鳞癌中的蛋白表达低于正常对照组并且具有统计学差异（p=0.0088）,E2F1表达也低于正常对照组并且具有统计学差异（p=0.0018）;在有/无淋巴结脉管浸润的两组间,RAD51AP1的表达程度不具有统计学差异,χ2=1.209,p=0.232,E2F1的表达程度也不具有统计学差异,χ2=3.070,p=0.081;在有/无淋巴结转移的两组间,RAD51AP1蛋白表达程度不具有统计学差异,χ2=3.238,p=0.087,E2F1的表达程度也不具有统计学差异,χ2=0.549,p=0.413;不同分期（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期）中,RAD51AP1蛋白表达程度不具有统计学差异,χ2=4.971,p=0.083,E2F1的表达程度也不具有统计学差异,χ2=1.186,p=0.553。结论:RAD51AP1是宫颈鳞癌中的差异表达基因,RAD51AP1与E2F1的表达呈正相关,RAD51AP1与E2F1在宫颈鳞癌中的蛋白表达水平显著低于正常宫颈组织,但它们在有无淋巴脉管浸润/淋巴结转移及宫颈癌不同分期及年龄段的蛋白表达水平无明显差异。
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