广西烟草病毒病病原的分子鉴定

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病毒病是烟草生产上的重要病害,为制定有效防治措施提供理论依据,我们对广西烟草病毒病的发生情况进行了调查鉴定。根据症状类型把病害分为花叶类病毒病、坏死类病毒病、曲叶类病毒病。通过ELISA、PCR、RT-PCR、小RNA测序等方法对采集的样品进行了鉴定,共鉴定出6种病毒,包括烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)、烟草脉带花叶病毒(TVBMV)、马铃薯Y病毒(PVY)、烟草环纹斑点病毒(TZSV)、番茄黄化曲叶病毒(TYLCV); TVBMV是首次在广西烟草上检测到,在花叶类病毒病样品中检出TMV、CMV、TVBMV,检出率最高的是TMV,检出率为58.7%,CMV次之,检出率9.8%,1个样品为TMV和CMV混合侵染,1个样品为TMV和TVBMV混合侵染。在坏死类病毒病中,PVY的检出率为4.3%,1个样品中检测到TZSV,从田林县八渡乡的烟草曲叶病样品中检测到TYLCV。对TMV、CMV、PVY三种病毒CP基因序列分析发现,7个TMV分离物CP基因之间存在27个碱基的差异,用软件翻译成氨基酸序列显示,仅BS-3、HZ-1与其他序列相比各存在1个氨基酸残基的差异,HZ-2与其它序列相比存在2个氨基酸残基的差异,将TMV CP序列与NCBI数据库序列比对发现BS-1、HZ-3与Yunan分离物相似性最高在99.6%以上,BS-2、BS-3、HZ-1与Fujian分离物相似度高于98.1%, HC-1、HC-2与Shanxi分离物相似大于99.6%。将CMV的HZ分离物与己知株系的序列构建系统进化树,可以推断其属于CMV亚组Ⅰ。通过将PVY的HZ分离物CP基因与已知株系的PVY CP基因做相似性比对和构建系统进化树,分析可得,PVY的HZ分离物CP基因可能属于0株系组。
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