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沙门菌(Salmonella)是一种重要的食源性致病菌,可通过动物及食物链向人传播,对人类健康和畜禽生产造成了严重危害,也对公共卫生安全问题造成了极大的影响。广东是中国南方经济发达省份,其畜牧业生产和畜禽产品消费居全国前列,畜禽产品的安全直接关系到消费者健康。但有关广东省农贸市场鸡肉和猪肉中沙门菌的流行特征和耐药性研究数据缺乏,给本省鸡肉和猪肉中沙门菌的防控以及人沙门菌病的预防带来了很大的困难。因此,本研究旨在了解广东省农贸市场鸡肉和猪肉中的沙门菌流行情况,血清型分布、耐药性、以及ESBLs基因型等特征,为畜禽养殖过程中抗生素的合理使用提供指导,也为预防和控制沙门菌提供了理论依据。同时对鸡肉中常见血清型沙门菌进行了喹诺酮类抗生素耐药基因携带情况检测和PFGE分子分型等研究,为监测耐药基因流行情况提供最新数据,也为耐药机制深入研究打下基础。获得以下主要结果:本研究在2016年至2017年期间从广东省(广州,深圳,河源,韶关,佛山及云浮)农贸市场共采集903份样本(包括475份鸡肉及428份猪肉),从中分离到沙门菌615株,总阳性率为68.1%。其中鸡肉302株(阳性率63.6%),猪肉313株(阳性率73.1%)。615株沙门菌共鉴定出38种血清型,并且鸡肉和猪肉样品之间的血清型差异大。其中鸡肉中鉴定出27种血清型,常见血清型为阿贡纳(55株,18.2%)、科瓦利斯(45株,14.9%)、肯塔基(38株,12.6%)和姆班达卡(32株,10.6%);猪肉中鉴定出25种血清型,常见血清型为鼠伤寒(78株,24.9%),罗森(67株,21.4%)、德比(66株,21.1%)和伦敦(48株,15.3%)。耐药性检测发现,总体耐药率最高的为磺胺复合物(76.1%),其次为四环素(75.3%)、氨苄西林(48.0%)和氧氟沙星(44.7%)等;所有沙门菌分离株对头孢吡肟、头孢他啶、阿米卡星和阿莫西林/克拉维酸的耐药率分别为2.8%、2.3%、1.3%和1.1%。值得关注的是,检测到临床上治疗细菌感染性疾病的“最后一线”药物多粘菌素B(2.0%)和亚胺培南(0.5%)耐药。菌株多重耐药率达77.1%,共得到61种不同的耐药谱,鸡肉沙门菌分离株(81.1%)中多重耐药率高于猪肉(73.2%)(P<0.05)。不同血清型沙门菌的耐药情况有所差异。ESBLs基因型检测发现,bla OXA-1是主要的ESBLs基因(9/21,42.9%),其次是bla CTX-M-55(5/21,23.8%)。本研究检测了鸡肉中常见血清型沙门菌对介导喹诺酮耐药性的喹诺酮类耐药决定区(QRDR)突变情况和质粒介导喹诺酮耐药基因(PMQR)携带情况,结果显示138株沙门菌PMQR基因总检出率为83.3%,qnr S、aac(6’)-Ib-cr、qnr B、qnr A、oqx AB和qnr D的检出率分别为71.0%、21.7%、18.1%、2.9%、1.4%和0.7%。阿贡纳和科瓦利斯沙门菌检测出的PMQR因子中以qnr S基因为主,肯塔基沙门菌中以aac(6’)-Ib-cr为主。阿贡纳、科瓦利斯和肯塔基这三种血清型沙门菌中的gyr A和par C的QRDR基因中检测到40个氨基酸突变。一些突变仅存在某种血清型上,如gyr A基因中Asp87Tyr突变仅发生于科瓦利斯沙门菌上;Ser83Phe和Asp87Asn突变发生于肯塔基沙门菌上;par C基因中Ser80Ile突变也仅发生于肯塔基沙门菌。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法研究沙门菌同源性关系,相同血清型菌株经PFGE分型后,55株阿贡纳沙门菌共呈现出44种不同的PFGE基因型,45株科瓦利斯沙门菌共呈现出34种不同的PFGE基因型,38株肯塔基沙门菌共呈现出29个不同的PFGE基因型。PFGE结果显示不同时间和地点分离到的相同血清型沙门菌呈现出相同或不同的基因型。本研究结果表明,广东省农贸市场鸡肉和猪肉中沙门菌污染严重,血清型复杂多样并且耐药性及多重耐药性非常普遍。提示应增强管理部门和生产部门食品安全意识,加强食品安全全程监管和执法力度以及严格控制抗生素使用。