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蒙古马是我国五大固有类型马品种之一,在长时间的自然选择以及人工选育条件下,逐渐形成了适应极端恶劣气候、耐粗饲、抗病和持久力强等特性。相比其他马品种,耐力性能极为突出,适合长距离赛事。国外对速度型赛马纯血马开展了大量运动学研究工作,而对蒙古马的运动学生理机制尚不明确。本研究选取6匹蒙古马为实验对象,用Miseq高通量测序技术对短期高负荷运动前后蒙古马的骨骼肌进行转录组测序和生物信息学分析。在专业骑手的骑乘下全速奔跑20 mins,分别在短期高负荷奔跑前与奔跑后活体采取骨骼肌组织,用Miseq高通量测序技术对样本建立转录组文库,并与纯血马基因组序列比对,进行差异表达基因分析及GO功能富集和KEGG pathway分析。结果显示:从转录组数据库中得到25367个SNP位点,其中1号和11号染色体SNP数目最多;另外还发现了4种可变剪接类型,其中外显子跳跃类型最多。短期高负荷运动后比运功前可变剪接数量明显提高。运动前后两组中共检测到205个显著性差异表达基因(P<0.05),120个基因上调,85个基因下调;GO功能富集分析结果显示,77%的差异表达基因富集于生物学过程、7.7%富集于细胞组分,15.3%富集在分子功能,其中在生物学过程中富集了PDK4、CYR61、TNNC1;在分子功能通路上富集了MYL3、LP1NI、TRIM63;在细胞通路上富集了ACTN、VEGFA、EGR2、ITGAV等基因。推测是由于短期高负荷运动使机体在循环系统,结合转录因子活性,酶结合等代谢机制发生变化所致;KEGG pathway分析发现,差异表达基因主要富集在脂质代谢、信号转导、细胞通讯、内分泌系统、心血管疾病等相关通路上;通过转录组数据分析,筛选了EGR2、MHC1、MYL3、ITGAV、TR1M63、LP1N1、ACTN、VEGFA、PDK4、CYR61等表达量发生显著变化的基因为蒙古马短期高负荷运动相关的候选基因,为未来我国开展短距离蒙古赛马奠定理论基础。