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子午沙鼠(Meriones merdianus Pallas,1773),属啮齿目(Rodentia),仓鼠科(Crietidae),沙鼠属(Meriones),食性复杂,分布广泛,是欧亚大陆中部荒漠、半荒漠的鼠种。国内主要分布于具有干旱、半干旱和荒漠化环境的内蒙古、新疆、青海、甘肃等地,作为荒漠化的指示鼠种,其适应进化的内容与生存环境的变化密切相关。本文以子午沙鼠为对象,通过对头骨量度进行统计分析并结合对线粒体Cytb序列分析,研究了国内子午沙鼠种群的形态差异及遗传变异,探讨了子午沙鼠形态差异与分子遗传变异之间关系。头骨形态研究:对子午沙鼠20个种群342个头骨样本的32个头骨量度进行测量,计算头骨的变异系数,比较种群间差异。将头骨量度与环境因子进行相关性分析,并依头骨量度特征对各种群进行聚类。结果发现:(1)不同种群间变异较大的头骨量度为相对颧宽(CV=6.41%~13.93%)、相对眶间宽(CV=5.24%~14.15%)、相对听泡体积(CV=5.66%-8.99%)和齿隙(CV=2.78%~10.49%),以及量度间总体变异系数较大的听泡体积(CV=17.79%)、颅体积(CV=15.65%)、下颊齿列长(CV=9.60%)和鼻骨长(CV=8.13%),且不同种群间同一量度差异显著(p<0.05);(2)所有绝对量度和颅体积、听泡体积、以及相对颧宽与海拔呈显著正相关(p<0.01),上颊齿列长、下颊齿列长、相对颅基长和相对腭长与纬度呈显著负相关(p<0.01);(3)子午沙鼠种群的系统聚类结果为两大支,A支包括冷湖、苏干湖、花土沟、巴彦淖尔、尉犁、安西、沙坡头、阿拉尔、金塔、且末、孟根、格尔木、榆中、淖毛湖、民勤和高台种群;B支包括古尔图、霍城、木垒和吐鲁番种群。分子遗传分析:对23个种群292个样本的Cyt b 755bp序列进行测序,分析其遗传多样性、系统发生关系。结果如下:(1)子午沙鼠具有较高的遗传多样性(S=103,h=93,Hdtotal=0.966±0.005,Pitotal=0.0400±0.00234);(2)AMOVA分析结果显示:子午沙鼠种群间遗传变异占(75.47%),种群内遗传变异占(24.53%);(3)23个种群归分为两大支:天山-新疆支(阿拉尔、古尔图、霍城、木垒和吐鲁番、)和天山南支(阿拉尔、安西、格尔木、巴彦淖尔、额济纳、高台、哈密、花土沟、金塔、孟根、‘民勤、诺尔根、且末、苏干湖、沙坡头、尉犁、乌兰、伊吾和榆中),与形态学分析结果一致。综合分析发现:(1)子午沙鼠形态差异较大,且具有较高的遗传多样性;(2)天山的地理隔离作用可能成为造成种群间遗传差异的主要原因;(3)栖息地环境的异质性对子午沙鼠遗传多样性产生影响。本研究为进一步研究动物系统进化和环境适应提供了科学依据。