科学研究是农业院校的重要任务之一,是提高人才培养质量的重要手段,也是推动社会发展、服务社会的主要任务。科研管理工作是一项较为复杂的系统工程,涉及科研人员、项目、资金、设备、成果评价、成果推广和应用等各个方面。规范高效的科研管理可以充分调动科研人员的积极性,最大限度地发挥资金和设备的作用,更好地发挥在培养人才方面的作用,可以加快科研成果的转化,并发挥科研成果在推动社会进步方面的积极作用。因此,科研管理评价具有重要意义。本研究主要做了如下工作：首先,构建了农业院校科研管理综合评价指标体系,主要包括科研人员管理、科研项目管理、科研经费管理、科研成果管理、大型科研设备管理、科研档案信息化管理6个一级指标及相应的20个二级指标。其次,构建了农业院校科研管理综合评价模糊层次分析(FAHP)模型,模糊层次分析法把具有广泛的应用性与优越性的层次分析法引入模糊领域,解决了层次分析法受限于主观模糊决策的问题。本研究拓展了FAHP法中计算模糊互补判断矩阵权重的方法,同时对检验模糊互补判断矩阵一致性进行了改进,并给出了农业院校科研管理综合评价的层次单排序和层次总排序模型。再次,利用所建立的评价模型对具有代表性的农业院校的科研管理水平进行了实证分析,分别得出了它们在6个一级指标下的评价结果和总的评价结果,并就评价结果给出了相应的建议。最后,利用Delphi与Matlab混合编程及Delphi和Excel应用程序的接口编程等初步构建了农业院校科研管理综合评价系统,给出了系统的演示效果。并展望了科研管理的发展方向,相信科研管理未来的发展方向会给农业院校的科研工作带来动力源。