两种臂尾轮属轮虫线粒体基因组的测定及其系统发生关系分析

来源 :安徽师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:weisu890221
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本次试验测定方形臂尾轮虫及剪形臂尾轮虫线粒体基因组全序列,并基于其蛋白质编码基因序列探究了它们在后生动物中的系统地位。  方形臂尾轮虫线粒体基因组由两个环状染色体组成,标示为 mtDNA-I(10707bp)及mtDNA-II(12149bp),mtDNA-I包含4个蛋白质编码基因(COB、ATP6、NAD1和NAD2),2个rRNA基因,13个tRNA基因及一段4.4 kb的非编码区;mtDNA-II包含8个蛋白质编码基因(COX1、NAD6、ND4L、COX2、COX3、NAD3、NAD4和NAD5),9个tRNA基因以及一段4.6 kb的非编码区;线粒体基因组A+T的含量为70.10%。  剪形臂尾轮虫线粒体基因组由两个环状染色体组成,标示为 mtDNA-I(10994bp)及mtDNA-II(12274bp),mtDNA-I包含4个蛋白质编码基因(COB、ATP6、NAD1和NAD2),2个rRNA基因,15个tRNA基因及一段4.6 kb的非编码区;mtDNA-II包含8个蛋白质编码基因(COX1、NAD6、ND4L、COX2、COX3、NAD3、NAD4和NAD5),8个tRNA基因以及一段4.6 kb的非编码区;线粒体基因组A+T的含量为67.55%。  选取方形臂尾轮虫及剪形臂尾轮虫12个蛋白质编码基因中的10个编码基因全序列(ATP6、COX1、COX2、COX3、NAD1、NAD2、NAD5、NAD6、NAD3和COB),并结合其它11种后生动物同源序列数据,重建了贝叶斯树,探究了臂尾轮虫轮虫的系统地位。
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