单中心原发性甲状旁腺功能亢进症患者致病基因筛查及临床特征分析

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhouxubo
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背景原发性甲状旁腺功能亢进症(Primary Hyperparathyroidism,PHPT,甲旁亢)是由于甲状旁腺本身病变引起的甲状旁腺素(parathyroid hormone,PTH)过多导致的钙、磷代谢紊乱的代谢性骨病。大部分PHPT为散发性(sporadic PHPT,SHPT),少数(<10%)病例为家族性或综合征性。目前关于PHPT患者的遗传学研究多基于一代测序技术,对特定年龄或临床表型患者进行某一个或少数几个PHPT致病基因的检测,结果可能存在选择偏倚,可能遗漏临床表现不典型的遗传性/综合征性PHPT病例;且在中国人群PHPT患者中遗传性PHPT所占比例及构成情况尚缺乏明确的数据。此外,新发现的PHPT致病基因GCM2基因在中国人PHPT发病机制中的作用尚无相关研究。目的本课题拟通过应用高通量DNA测序技术对本中心新诊断PHPT患者进行系统性的致病基因筛查:1、了解中国人PHPT患者中遗传性/家族性PHPT所占比例及病因构成,结合变异基因型进一步分析临床表型特征;2、探索PHPT新致病基因GCM2在中国人PHPT发病机制中的作用,总结GCM2变异相关PHPT的临床特征。3、进一步了解本中心MEN1相关的PHPT(MHPT)患者遗传背景及临床特征。对象和方法1、在2015年8月~2019年8月于北京协和医院内分泌科就诊的新诊断的PHPT汉族患者中,连续纳入同意进行基因检测的患者,应用目标区域靶向二代测序技术(Panel包含基因:MEN1、RET、CDKN1B、CαSR、HRPT2/CDC73、GNA11、AP2S1、GCM2)联合MEN1-MLPA和CDC73-MLPA进行PHPT致病基因的筛查,依据ACMG进行罕见变异的致病性分类。根据临床表现、家族史及基因检测结果,筛查家族性/综合性PHPT,比较遗传性PHPT与非遗传性PHPT的临床特征差异。应用体外双荧光素酶报告基因实验对GCM2罕见变异进行体外功能验证,并对携带GCM2基因胚系激活性变异的PHPT病例临床特点进行总结。2、纳入1984年1月~2020年1月于北京协和医院内分泌科就诊的MHPT病例,应用Sanger测序技术及目标区域靶向二代测序技术对MHPT患者进行筛查,对于明确诊断MHPT但基因筛查阴性患者,进一步完善MLPA检查;匹配同时期临床散发的PHPT患者,比较MHPT与散发性PHPT患者临床特征差异。3、临床资料部分采用回顾性病历复习,收集一般情况、PHPT相关临床表现及生化指标、遗传性PHPT临床评估、影像学检查及病理结果,应用双能X线吸收仪(GE-Lunar)测定面积骨密度,同版本TBS软件(iNsightv2.1)计算骨小梁分数。结果本研究分别纳入394例连续诊断的汉族PHPT患者用于第一、二部分研究;120例MHPT患者及同时期临床散发性PHPT患者360例用于第三部分研究。1.单中心大样本量PHPT患者致病基因筛查及临床特征总结(1)PHPT患者基因变异谱394例患者二代测序共发现103例患者携带79种罕见非同义变异,在41例患者中共检出37种致病性或可疑致病性变异,检出率为10.4%,其中27个为新发现的变异。通过MLPA进一步筛查出3例大片段缺失,将检出率提升至11.2%(44/394)。另有30例临床诊断MEN1的患者,其中19例携带MEN1-VUS变异,11例未携带MEN1罕见非同义变异。联合基因筛查和综合征性PHPT相关临床筛查,本研究遗传性PHPT诊断率为 18.8%(74/394)。(2)遗传性PHPT组和非遗传性PHPT组临床特征的比较遗传组患者74例,非遗传组患者262例(除外临床诊断的综合征性PHPT患者及所有罕见变异携带者)。遗传组患者就诊年龄及起病年龄均显著低于非遗传组患者(就诊年龄:43.6±14.0vs.53.7±14.9,起病年龄:35.4±13.8vs.50.6±14.8,P值均<0.001),男性所占比例明显高于非遗传组(44.6%vs.24.0%,P<0.001)。遗传组患者游离钙及血β-CTX水平较高,但血清总钙、PTH等其他指标均无显著差异。病理方面,遗传组患者甲状旁腺增生及多腺体受累所占比例显著高于非遗传组。(3)突变组与非突变组临床特征的比较突变组患者63例,共包括44例患者携带致病性/可疑致病性变异(包含3例携带大片段缺失患者),另有19例临床诊断为MEN1患者携带MEN1-VUS变异;非变异组患者269例(除外所有罕见变异携带者),两组组间差异与前述遗传组和非遗传组大致相同,但突变组病理除增生外,腺癌比例也显著高于非突变组。(4)提示遗传性PHPT的相关因素分析对提示遗传性PHPT的相关因素(起病年龄、性别、是否为无症状患者、血游离钙、血清总钙、PTH和是否多腺体受累)进行二分类logistic回归分析,结果表明当其他变量保持不变时,多腺体受累患者相较于单腺体受累患者,患遗传性PHPT的优势比为6.175倍;起病年龄每增加1岁,优势比为0.967倍。进一步对年龄进行诊断切点计算,分段线性模型计算结果提示患者约在35岁时患病风险概率发生较大改变,ROC曲线结果提示患者起病年龄≤38岁时敏感性大于80.53%,起病年龄≥49岁时特异性大于81.08%。2、PHPT患者GCM2基因胚系变异功能验证及临床特征分析394例患者中共发现12例患者携带GCM2基因罕见变异,其中共5例患者携带4种GCM2罕见错义变异,分别为c.488A>G(p.E163G),c.1162A>G(p.K388E,n=2),c.1144G>A(p.V382M)和c.1247A>G(p.Y416C)。双荧光素酶报告基因功能实验提示位于高度保守区域(CCID区:aa 379-395)的两个变异(p.K388E和p.V382M)与GCM2转录功能的激活相关,分别使转录活性升高为野生型的1.79倍和1.74倍(P<0.05)。5例(男性/女性:4/1)携带GCM2错义变异患者的平均诊断年龄52.0±15.6岁,中位血钙3.04(3.00,3.30)mmol/L,中位PTH427.0(250.3,647.0)pg/mL,所有患者均接受甲状旁腺探查+腺瘤切除术,携带p.K388E变异的2例患者及p.Y416C的1例患者病理诊断均为甲状旁腺癌,携带p.V382M变异的患者病理为非典型腺瘤。1例患者术后未缓解并且拒绝再次手术治疗,1例患者术后2年时出现原位复发,再次手术后缓解,其余3例首次术后即缓解且尚未复发(随访时间分别为4.5年、3年、4年)。3、MHPT患者MEN1基因胚系变异筛查及临床特征总结(1)MHPT患者MEN1基因胚系变异筛查120例临床诊断的MHPT患者中共103例携带78种MEN1基因变异,变异检出率85.8%。根据ACMG分级,51例患者携带致病性/可疑致病性变异(包含3例MEN1大片段缺失),52例患者携带VUS变异,1例携带MEN1同义变异,5例携带其他基因VUS变异。移码变异和错义变异所占比例最高,未观察到热点变异区域。17例患者未携带MEN1基因罕见非同义变异,平均诊断年龄偏大(基因筛查阴性患者47.8±14.8岁vs.基因筛查阳性患者41.8±13.1岁,P=0.02),其余临床特征与基因筛查阳性患者无显著差异。(2)MHPT患者与同时期SHPT患者临床特征比较MHPT患者120例,随机匹配同时期SHPT患者共360例。MHPT组包括50名男性,70名女性;中位年龄43.5(31.5,52.0)岁,较SHPT患者更为年轻(P<0.001),男性所占比例也更高。MHPT患者最常见临床表现为肾结石/肾钙化,共65例(54.2%),高于对照组的35.6%(P<0.001);消化道及骨骼受累、血清总钙及游离钙、PTH等两组间均无统计学差异。MHPT组共96例(80.0%)患者行手术治疗,术后病理包括增生43例(44.8%)、腺瘤49例(51.0%),另有3例不典型腺瘤及1例腺癌(4.2%)。13例(13.5%)患者术后未缓解,83例(86.5%)患者术后血钙及PTH降至正常,其中24例(24/83,28.9%)术后0.5年至15年间出现复发。(3)MHPT患者与年龄及性别匹配的SHPT患者骨骼受累情况比较MHPT患者共86例在我院进行了骨密度及TBS检查,随机匹配同年龄、性别、时期的SHPT患者86例。MHPT患者腰椎骨量及TBS均显著低于SHPT患者(骨量:0.91±0.18 g/cm2 vs.1.01±0.17 g/cm2;TBS:1.22±0.14 vs.1.29±0.11,P值均<0.001);两组患者全髋及股骨颈骨量无显著差异。依据TBS结果:34例骨密度正常的MHPT患者中15例(44.1%)存在骨微结构受损,6例(17.6%)为骨微结构部分受损;45例骨密度正常的SHPT患者中6例(13.3%)骨微结构受损,6例(13.3%)骨微结构部分受损。结论本研究在大样本量连续纳入的中国PHPT队列中明确遗传性PHPT所占比例为18.8%,其中临床诊断62例遗传性PHPT(15.7%),通过T-NGS在无遗传性PHPT临床表现的患者中发现12例(3.0%)携带致病性/可疑致病性变异者。阳性家族史、起病年龄小于40岁、多腺体受累均是遗传性PHPT的相关因素,建议有遗传性PHPT相关因素的患者同时进行综合征性PHPT临床筛查及T-NGS基因筛查,如有必要则进一步行MLPA筛查。本研究GCM2功能获得性变异均位于CCID内,研究纳入的PHPT患者中变异频率为0.8%,其病理类型结果支持携带激活性GCM2变异的病例中存在更高的恶性趋势。本研究队列中MEN1基因的变异检出率为85.8%,未观察到热点变异区域,基因筛查阴性患者就诊年龄偏大,但其余临床特征与基因筛查阳性者无显著差异。与SHPT患者相比,MHPT患者就诊年龄更小、泌尿系受累比例较高、TBS提示的松质骨骨微结构受损更为严重,但血钙及PTH无明显差异,甲状旁腺增生及多腺体受累比例较高。
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