商业银行效率的高低不仅是银行业绩的内在表现，更代表了一个银行在金融市场上的实际竞争能力。自1997年重庆市直辖以来，地区经济金融不断飞速的发展，不仅金融资产的规模不断扩大，更在制度方面进行不断完善。一个商业银行运行情况的优劣不应只体现在规模和功能方面，银行效率更是深层次的关键所在。本文首先回顾了国内外商业银行效率研究的相关文献，梳理相关理论模型和实证结论，为重庆市商业银行效率的研究提供参考依据。之后，通过对商业银行效率理论的经济学原理的研究，对比分析不同的理论观点，并结合本文的研究需要，最终确定将服务效率和盈利效率的“双效率”的分析视角引入到对重庆市商业银行的效率的研究过程中。在实证研究的过程中，首先分析了我国商业银行发展的经济金融背景，通过对重庆市相关经济指标的具体分析，把握重庆市商业银行的现状水平与发展趋势，突出商业银行效率研究的意义。本文首先使用超效率DEA模型，对2012年重庆市商业银行25家商业银行进行静态效率分析，对重庆市商业银行的效率现状进行评价。之后本文利用全要素生产率Malmquist指数方法，分析了其中15家商业银行在2008-2012年的服务效率和盈利效率变动情况，并总结出各家商业银行的效率增长差异。为了进一步分析引发效率变动的原因，综合考虑了各方面影响，最终从中微观层面选取银行的市场份额、稳定性、贷款质量、资源配置、以及创新能力等五个因素，并确定总资产占比、负债率、柜面覆盖率、不良贷款率、存贷比、中间业务收入占比这些指标的增长率为模型的解释变量。在分别以重庆市商业银行服务效率和盈利效率的Malmquist指数为被解释变量的模型的回归结果进行分析后发现，重庆市商业银行的效率增长主要还是来源于规模扩张和内部调整，创新能力的增长对重庆市商业银行的服务效率和盈利效率的变动影响在现阶段并不明显。据此，本文在最后对实证研究进行总结并给出重庆市商业银行效率的提升路径建议。