本文共分五章： 第一章：介绍了毛细管电泳（CE）的基础理论和毛细管电泳的发展状况。 第二章：建立了毛细管区带电泳分析中药金银花中绿原酸的分析方法。最佳分离条件为，缓冲液10mmol/L硼酸盐+19mmol/磷酸盐+10％乙醇（pH=8.86），电压16kV。紫外检测214nm。此方法用于分离鉴定中药金银花中的绿原酸具有样品处理简单、定量准确的特点。 第三章：建立了中药穿心莲中有效成分穿心莲内酯、脱氧穿心莲内酯和新穿心莲内酯的胶束毛细管电泳（MEKC）分析方法。缓冲体系包括硼酸盐和SDS（pH=9.5）。通过优化分离参数，例如，SDS浓度、pH值、背景电解质的相对浓度等。使这三种有效成分均能和其相邻组分实现基线分离。此分离条件也适合于穿心莲制剂，如穿心莲片和消炎利胆片中有效成分的分离测定。另外，本文将建立的胶束毛细管电泳分析方法同高效液相色谱法（HPLC）进行了比较。 第四章：建立了胶束毛细管电泳（MEKC）分离合成产物维生素E中的异构体的实验方法。本实验采用SDS和胆酸盐为混合胶束，以乙腈为有机改性剂，成功分离了合成产物中的杂质、结构异构体和旋光异构体。另外，本文考察了对多个分离参数，如SDS浓度，胆酸盐浓度，乙腈比例，缓冲液pH值等对分离的影响。 第五章：介绍了毛细管电色谱（CEC）的研究进展，包括电色谱柱的制备、柱填料、CEC的梯度洗脱及其CEC发展前景探究。