断奶前后健康仔猪与腹泻仔猪粪便菌群的比较研究

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目的 利用PCR-DGGE技术分析断奶前后仔猪粪样细菌区系变化,并比较腹泻仔猪与健康仔猪粪样菌群的结构差异。 方法 选取各日龄(出生到断奶(30日龄)后两周)腹泻仔猪的粪便,同时取同窝、同性别、体重相近健康仔猪的新鲜粪便。提取粪便样品中细菌的混合DNA,再对其16S rDNA的V<,3>可变区进行PCR扩增,扩增产物经DGGE电泳后进行相似性分析。同时,比较同日龄腹泻仔猪与健康仔猪粪样DGGE谱带的异同,找出特征性带,回收测序后确定菌属。 结果 断奶前,仔猪粪样DGGE条带较少,同窝仔猪谱带相似,有一些位置相同的条带。断奶后,随着时间的推移,图谱条带逐渐增多,仔猪个体间条带差异也逐渐增大。仔猪是否同窝对DGGE条带没有明显影响,同日龄腹泻仔猪与健康仔猪间DGGE条带有明显差异,多出现一到两条较明显的优势条带,特征条带经回收测序确定属于肠杆菌。 结果表明,仔猪从出生到断奶前后,肠道优势菌群结构从单一到复杂,随着日龄的增长,优势菌群结构发生了明显改变:由于致病菌的优势定殖,导致腹泻仔猪肠道菌群紊乱,较健康仔猪粪样细菌DGGE条带减少,但致病菌形成特征条带。本研究结果不仅可为仔猪腹泻的临床治疗提供参考依据,也可为今后研究仔猪腹泻时肠道通透性改变的机理,起到一定的借鉴作用。
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