玉米1768突变体的图位克隆及其功能分析

来源 :上海大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hanbing5
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
玉米是世界上产量最高的农作物,其产量及品质问题一直被育种家们广为关注。玉米籽粒是重要的营养储藏器官,也是决定玉米产量与质量的重要因素。玉米籽粒突变体是研究玉米籽粒发育和储藏物积累等基本生物学问题的良好素材。玉米籽粒突变体1768为单个隐性核基因控制的籽粒缺陷型突变体,其成熟籽粒不透明(opaque)、扁平、胚乳粉质化且籽粒不能萌发。成熟籽粒醇溶蛋白的SDS-PAGE电泳分析表明,1768突变体中27 kDa醇溶蛋白有所下降,但22 kDa醇溶蛋白略有上升。石蜡切片显示,突变体的胚具有严重的发育不全的现象,这可能是该突变体籽粒无法萌发的重要原因。本研究通过1090株(野生型372株,突变体718株)F2群体的分析,将玉米1768突变体基因精细定位在玉米1号染色体短臂上约0.28M的物理区间内。该区间包含31个基因。结合基因组测序以及RNA-seq数据分析,发现与野生型相比,1768突变体Gene6基因组的第8546个碱基发生了A-G的突变,引起了第21个内含子末端保守序列从GT-AG改变为GT-GG。该突变引起了1768突变体Gene6的转录本剪切位点的改变,造成开放阅读框缺少了13bp,造成蛋白翻译的移码及提前终止。通过Protein BLAST比对分析,发现Gene6编码了一个Rrp44(Dis3)蛋白,属于RNR超家族,同时具有核酸内切酶活性及核糖核酸外切酶活性。进化树分析进一步证明,该基因编码了外切体复合物亚基之一的核糖核酸外切酶Rrp44。Rrp44蛋白是真核生物RNA处理外切体复合物的第十个核心亚基,它为外切体复合物提供活性,是真核生物中的必须蛋白。1768突变体Gene6中A-G碱基的突变造成的ORF提前终止使其编码的蛋白比野生型缩短了83个氨基酸,缺失了C-端的S1结构域,从而影响了Rrp44蛋白的功能。Rrp44蛋白S1结构域的缺失导致玉米1768突变体的胚发育不全,从而影响了玉米突变体籽粒的生长发育。Rrp44在其他物种中的研究已经比较成熟,但在玉米中目前尚无相关研究,本研究拟通过对1768突变基因的克隆及功能分析,进一步探索Rrp44在玉米籽粒发育过程中的作用。
其他文献
执行时间、调度费用、资源利用率和能源消耗是衡量工作流调度优劣的关键评估标准,然而相对于传统分布式系统例如网格计算,云计算由于其复杂多变的特性,导致这些评估标准所受
随着物联网等技术的发展,姿态识别在生物医疗、人机交互、智能家居等重要领域扮演越来越重要的角色。我国人口老龄化趋势加剧,老年人口日益增多,直接或间接造成大量的社会负
近年来随着计算机硬件、互联网、大数据等技术的快速发展,用户被海量的信息包围。对用户来说,如何在日益增长的信息库中找到自己需要的信息是一件非常困难的事情。为了让用户
种子包衣作为种子加工处理中关键的一环,具有提高种子抗病虫害能力,促进种子萌芽的重要作用。种子包衣处理的结果也对种子质量影响巨大。自我国推广种子包衣技术以来,种子包
在国家加大力度投资新基建的背景下,我国智能电网迎来飞速发展,配网自动化是智能电网的重要一环,而配电自动化系统功能的实现必须基于安全、可靠、坚强的通信系统。通信系统
我国的纺织行业生产规模庞大,在全球市场中占据龙头地位,但是生产模式仍处于劳动密集型的生产阶段。目前布匹生产过程中的质量检测大多依赖于人工巡检,不仅效率低下,而且由于
研究目的:原纤毛(primary cilia)可参与多种信号通路,进而可能调控肿瘤的发生发展。细胞中心粒微卫星处的OFD1(Oral-FacialDigital type I syndrom,OFD1)蛋白能抑制原纤毛形
多媒体技术催生了高清视频的发展,视频分辨率需求逐渐增长为1080p高清电视(HDTV)、3840x2160p超高清电视(UHDTV)以及更高,在庞大的视频数据规模下,视频编码技术也在逐渐发展。H.265/HEVC标准于2013年起成为当前最为通用高效的视频编码标准,其带来超高压缩效率的同时也造成了编码运算复杂度的大大增加,因此优化H.265/HEVC的编码计算是当前国内外研究的重点。CABAC作为
岷江上游地区是一个自然灾害频发的地带,一旦灾难发生,常带来难以估计的后果,作为灾难应对的最后一个阶段,灾后重建中的地方重建与恢复在一定程度上关乎受灾地区的当下与未来的发展,是一个系统漫长的社会恢复过程,在其中,各种社会关系和资源在新的历史条件下将会被重新整合与分配。因此,对于灾后重建影响的研究正是当下灾难人类学研究需要不断深入和来扩展的领域。本研究以岷江上游的较场村为田野民族志个案进行研究,借助以
随着科技的发展,人们越来越重视云计算和云安全等方面的安全和隐私保护的问题。云环境下多媒体数据的共享会伴随着数据泄漏的隐患。为保证多媒体数据安全、防止多媒体数据被