MicroRNA(miRNA)是内源非编码小RNA,通常长度为21个核苷酸。miRNA来自茎环前体(pre-miRNA),它们在植物生长发育以及环境胁迫中通过以序列互补方式对靶向mRNA进行切割或翻译抑制而发挥重要作用。然而,目前还没有关于银杏叶片中环境胁迫响应miRNA的研究。本研究主要致力于银杏叶片中的miRNA,通过生物信息学分析和高通量测序的方法,挖掘银杏在干旱、紫外、激素胁迫下相关的miRNA,对银杏差异表达的miRNA进行分析,筛选已知的miRNA,并预测银杏中发现的新miRNA,从而深化对于银杏抗性分子机制的理解,初步探讨miRNA在银杏抗性反应中所起的调控作用。主要研究结果如下:(1)利用高通量测序,经数据过滤后,获得样品CLG、UVG、DRG、CCG、CVG、CRG的clean reads序列条数分别为7648427、7745539、7469773、11614517、6463373、7903059。参考序列比对分析发现,矮壮素、干旱、紫外三个处理组比对照组比对到参考序列的reads百分数都降低,分别从82.83%降到79.89%,81.37%降到78.46%,83.45%降到72.05%。说明miRNA分子可能在内源性调控矮壮素、干旱、紫外胁迫过程中起着重要作用。已知miRNA分析,所有的组总共匹配到miRNA成熟体有12个,匹配到的miRNA前体有14个,匹配到已知miRNA前体的sRNA种类有412,匹配到已知miRNA前体的sRNA个数有72829。(2)miRNA差异表达分析发现,CCGvsCRG组合中,sRNA的总数为66,其中显著差异表达的miRNA有17个,上调的miRNA有9个,下调的miRNA有8个,该结果表明,这些miRNA可能在银杏应对矮壮素处理过程中起作用。DRGvsCRG组合中,19个显著差异表达,7个上调,12个下调,这些miRNA可能在银杏应对干旱条件下起作用。UVGvsCVG组合中,34个显著差异表达,11个上调,23个下调,这些miRNA可能在银杏应对紫外胁迫时起作用。(3)新miRNA鉴定结果显示,预测到的成熟体总数为54,预测到miRNA*链总数为41,预测到前体总数为55,匹配到新miRNA前体的sRNA种类的总数为1898,匹配到新miRNA前体的sRNA的总个数为211058。(4)miRNA靶基因功能注释和GO分析,其主要功能有翻译、复制、信号转导、氨基酸和碳水化合物的运输及新陈代谢等。这也证明了生物体的生长发育可在miRNA调控下完成,同时,细胞分化以及新陈代谢等功能也需要miRNA的调控。