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枣(Ziziphus jujuba Mill.)隶属于鼠李科(Rhamnaceae)枣属(Ziziphus),具有悠久的栽培和驯化历史。枣在长期的栽培过程中,在果实大小方面形成了丰富的变异,然而导致这些变异的分子调控机制并不清楚。本研究通过两组具果实大小相对性状的种质群体进行简化基因组测序,获得SNP标记后进行亲缘关系、群体遗传结构和遗传多样性分析,解析枣品种的群体遗传关系和结构。通过多种方法鉴定的受选择区域,进一步对受选择区域所包含的基因进行基因功能及通路的生物信息学分析,并对多个分析中筛选到的基因以及其中与细胞周期调节、细胞分裂以及激素相关的候选基因在桐柏大枣和酸枣果实发育过程的相对表达量进行了比较分析,主要结果如下:(1)大果和小果群组:共获得130077个高质量的SNPs,大果类型枣种质的遗传多样性(π:0.3214)低于小果类型枣种质(π:0.3273),大果类型枣种质连锁不平衡较高,并且具有杂合的选择优势,受选择力度较高。大果和小果群组分别检测到83和149个受选择基因。(2)栽培品种和野生酸枣群组:共获得315915个高质量的SNPs,栽培品种和野生酸枣的遗传多样性分别为:π:0.3100和0.3236,野生酸枣的遗传多样性较高。不同的栽培枣品种可能由不同的酸枣独立驯化而来。四种方法鉴定到的受选择基因有124 个。(3)两个群组分析鉴定出8个参与细胞周期、细胞分裂或激素合成调控途径的重要候选基因(LOC107404981、LOC107406728、LOC107424132、LOC107426306、LOC107418232、LOC107432595、LOC107418355和LOC107411529)。对它们进行 qRT-PCR分析表明,候选基因LOC107404981、LOC107406728和LOC107418355在花后45天和75天增加较多,可能是调控枣果实大小的目的基因。(4)从’冬枣’成功克隆候选基因ZjTIFY10并构建过表达载体PRI101-AN-ZjTIFY10,利用农杆菌介导的方法进行酸枣的遗传转化,获得13个再生芽。