企业技术创新是国家创新体系的重要组成部分。企业的创新活动受到组织内部和外部环境多种因素的影响,目前我国企业的研发投入力度仍然较低,其中一个重要影响因素就是环境不确定性。尽管国内外学者已经在环境不确定性对企业研发投入的影响中形成了许多研究成果,但是其研究结论还未统一,如何在复杂多变的环境中保持研发投入力度,进而提升创新能力是始终是理论界和实务界关注的重点,因此对环境不确定性下企业研发投入的研究具有重要的理论意义和现实意义。基于此,本文选取2007-2018年我国A股非金融类上市企业作为研究对象,实证研究了环境不确定性和研发投入之间的关系,验证了第二类代理成本和融资约束的中介效应,从企业内部和外部两个视角分别选取了管理者过度自信和政府补助两个变量,验证了两者的调节作用。文章通过对数据的描述性统计和相关系数矩阵进行分析,对环境不确定性和研发投入的关系进行了多元回归分析,对中介效应采用了三步回归法、Sobel检验法和Bootstrap检验法,对调节作用的检验采用了多元回归分析法,最后进行了稳健性检验和内生性检验。通过上述分析得出了相应的研究结论,并从企业和政府的角度提出了一系列政策建议。最后,文章提出了研究可能存在的局限性,为今后相关领域的研究提出了可参考的建议。通过实证检验本文得出了如下结论:（1）环境不确定性与企业研发投入显著负相关。检验中介效应发现环境不确定性对企业研发投入的抑制作用主要通过第二类代理成本和融资约束进行传导。环境不确定性导致信息不对称程度加剧,控股股东对小股东的利益侵占行为增加,最终导致研发投入减少。同时,由信息不对称产生的融资约束问题也抑制了企业的研发投入。（2）管理者过度自信和政府补助均显著负向调节环境不确定性和研发投入之间的关系,表明管理者过度自信和政府补助能够削弱环境不确定性对研发投入的负面影响。过度自信的管理者在面对环境不确定性时更容易表现出较高的风险承担能力和冒险精神,从而有利于企业研发活动的进行。政府补助能够通过直接向企业提供研发活动所需的现金流,并且向外部投资者释放有利信号,吸引外部资金流向企业,有利于企业研发活动的进行。（3）区分管理者过度自信样本和管理者自信不足样本后,继续检验了政府补助对环境不确定性和企业研发投入两者的调节作用,结果显示政府补助的调节作用只在管理者过度自信样本中显著,在管理者自信程度较高时,一方面代理问题较小,管理者攫取私有收益的动机较小,政府补助能够真正的流向创新项目中去;另一方面,过度自信的管理者在政府补助信号传递作用的激励下能够更有信心从事研发活动,因此当管理者自信程度较高时,政府补助能够更好的削弱环境不确定性对研发投入的抑制作用,管理者过度自信和政府补助的调节作用存在协同效应。