近年来,高校科研项目蓬勃发展,按照科研经费来源划分,高校科研分为横向科研项目和纵向科研项目。纵向科研是指上级部门为了解决某一技术难题提供经费的科研项目,横向科研项目是指高校与企业或事业单达成的技术合同。如今,大学科研项目经费的多少成为衡量大学水平的重要指标,因此,高校都充分发挥科研职能,培养大学科研团队,扩展科研项目。横向科研项目的发展,不仅可以促进高校科学研发能力的进步,还可以从中得到经济收益。本论文选取高校横向科研项目为研究对象,主要是由于随着中国经济的发展,科研水平的重要性日益突出,大学作为科研的重点部门,其职能也日益突出,面对这种情况,大学横向科研项目引起各界关注。然而从目前状况来看,高校横向科研项目依然缺乏有参考价值的探讨,在预算绩效考评上,现阶段的研究都是将纵向科研的成果生硬套用在横向科研上,这样的方式,一方面缺乏科学研究的严谨性,另一方面,也缺乏科研的创新性。本文将平衡计分卡的功能与横向科研项目的独特性相结合,又参考平衡计分卡在企业和非营利机构应用的优秀案例,将平衡计分卡这一工具切实可行的运用到横向科研项目预算绩效考评中来,从平衡计分卡的四个维度进行研究。此外,本论文还分析了与横向科研项目预算绩效相关的重点因素,构建起一个基于平衡计分卡的横向科研项目预算绩效评价体系,形成了一套比较科学和具有相关性的预算绩效评价体系。