目的：研究人博卡病毒（HBoV1）在重庆地区呼吸道感染住院患儿中的流行情况，分析HBoV1病毒载量与病情相关关系；对HBoV1阳性样本进行基因测序，分析HBoV1基因突变与临床症状、病毒载量的关系。方法：收集2009年6月至2011年5月因呼吸道感染（RTI）于重庆医科大学附属儿童医院呼吸科住院患儿的鼻咽抽吸物（NPA）标本，共846份。 Real-Time Quantitative PCR检测HBoV1，分析HBoV1病毒载量与临床症状之间的关系；对HBoV1阳性样本进行基因测序，分析基因突变与临床症状、病毒载量的关系。将HBoV1阳性样本扩增后测序获得的HBoV1临床株与st2株进行比对（GenBank acces sion no.DQ000496），序列比对使用MAGA5软件进行。实验数据应用SPSS17.0软件进行统计分析。结果：846份NPA中，HBoV1阳性112例（13.2%），以夏季流行为主，主要感染6月-2岁患儿。病毒定量研究发现，高载量的HBoV1更容易引起肺炎与腹泻。对HBoV1阳性样本进行测序，得到27个HBoV1全基因组序列，2个NS1基因序列，15个NP1基因序列和10个VP1/VP2基因序列，三个基因中分别发现23个、10个和43个突变位点。HBoV1基因突变与患儿的临床表现没有明显的统计学关系。在有NP1基因236位点（G236A）、447位点（A447G）以及VP1/VP2基因1461（G1461A）位点突变的样本中，病毒拷贝数明显低于未发生突变的样本。结论： HBoV1主要感染6月至2岁儿童，在重庆地区夏季为HBoV1流行季节。高载量HBoV1更容易引起肺炎和腹泻。HBoV1基因突变与临床症状无明显关系，NP1基因236位点（G236A）、447位点（A447G）以及VP1/VP2基因1461（G1461A）位点突变可能影响病毒的复制。