【摘 要】
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背景与目的C9基因是一种蛋白质编码基因,相关研究表明它可能是一种潜在的肿瘤生物标志物。然而,C9基因在肝细胞癌中的表达及其作用机制的研究鲜有报道。本研究通过对公共数据库的数据挖掘及实验验证确定了C9基因在肝细胞癌中的表达水平,分析了C9基因表达与肝细胞癌预后的相关性,通过生物信息学分析及其邻近lnc-RNA的研究推测C9基因在肝细胞癌中的分子机制,为肝细胞癌的诊断和靶向治疗提供了新的思路。方法本研
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背景与目的C9基因是一种蛋白质编码基因,相关研究表明它可能是一种潜在的肿瘤生物标志物。然而,C9基因在肝细胞癌中的表达及其作用机制的研究鲜有报道。本研究通过对公共数据库的数据挖掘及实验验证确定了C9基因在肝细胞癌中的表达水平,分析了C9基因表达与肝细胞癌预后的相关性,通过生物信息学分析及其邻近lnc-RNA的研究推测C9基因在肝细胞癌中的分子机制,为肝细胞癌的诊断和靶向治疗提供了新的思路。方法本研究通过分析GEO数据库中m RNA微阵列数据集,获得在肝细胞癌中差异表达的C9基因的表达谱数据,同时进行荟萃分析。收集13例患者的配对组织样本,使用RT-q PCR检测C9基因在肝细胞癌中的表达情况,结合免疫组化结果,进一步确定C9蛋白在肝癌中的表达水平。从TCGA数据库中获取的数据用于探讨C9基因表达水平与肝细胞癌患者的预后之间的相关性。此外,本研究还构建了共表达基因网络,对C9基因的共表达基因进行生物信息学分析。利用RT-q PCR检测lnc-C9在肝细胞癌中的表达情况,进一步研究C9基因在肝细胞癌中的分子机制。结果从GEO数据库中获取的数据集的荟萃分析结果显示,C9基因在肝细胞癌组织中的表达低于正常肝组织（SMD=-1.79,95%CI=-2.01,-1.58,P=0.00）。RT-q PCR的结果证实肝细胞中C9基因（P<0.01）和Lnc-C9（P=0.0215）表达下调。免疫组化进一步证实C9蛋白在肝细胞癌组织中表达水平较癌旁组织更低。TCGA数据分析结果显示,C9基因的表达与患者性别、T分期、肿瘤分期高度相关（P=0.01276,P=0.00593,P=0.00704）。生物信息学分析共共获取130个C9基因的共表达基因,这些共表达基因在代谢途径、补体和凝血级联等关键途径中高度富集。结论公共数据库的数据分析及RT-q RCR实验结果显示,C9基因及C9蛋白在肝细胞癌组织中的表达低于正常组织,肿瘤切除或无远处转移的患者在C9基因表达下调时预后较差,C9基因的下调可能预示不良临床结局。Lnc-C9在肝癌中的表达水平与C9基因呈正相关,生物信息学分析为研究肝细胞癌发生发展的机制提供新的思路。
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