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堆肥化是依靠自然界广泛分布的细菌、真菌、放线菌等微生物,是自然界微生物降解过程的强化,微生物是堆肥处理系统中的主有功能生物,充分了解其中的微生物学原理能为改进堆肥处理工艺、提高堆肥处理效率提供理论依据。但基于培养和分离纯化的环境微生物群落研究方法已经无法满足研究者对环境微生物进行快速、准确的分析与鉴定的要求。利用分子生物学技术PCR-DGGE,研究者可以在不对微生物进行分离培养的情况下对其进行研究,并进行微生物群落的结构和功能进行分析,结果快速、准确。本论文使用基于16S rDNA的PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术对城市餐厨垃圾堆肥过程中细菌种群结构随时间的变化进行了研究。在堆肥不同时间取样,进行了堆肥物理化学参数的变化分析和DGGE分析,结果显示,堆肥最终pH值接近7.5;C/N为20.04;堆肥温度高于50℃天数为7d,最高达64℃,可有效杀灭致病菌;PCR-DGGE图谱显示,不同时间堆肥样中细菌DGGE图谱有着明显的差异性,堆肥升温期细菌种群丰富,优势种群不明显;高温期细菌种群减少,优势种群明显;降温期细菌种群结构基本保持稳定。温度对堆肥过程中细菌种群具有明显的筛选作用。堆肥各阶段DGGE图谱相似性Cs值比较低,堆肥处理后细菌种群结构与堆肥原料之间存在明显差异。使用PCR-DGGE和系统发育分析对餐厨垃圾高温堆肥中嗜热细菌种群结构进行了研究。研究对象为堆肥高温阶段(>50℃)的7d,从这7d的堆肥样中提取微生物总DNA,使用细菌通用引物对(GC-341F/907R)从总DNA中成功PCR扩增出目标16S rDNA片段,对扩增16S rDNA进行DGGE分析,DGGE条带相似性Cs值分析和切胶测序,使用序列数据进行同源性分析并建立了系统发育树。结果表明,堆肥高温阶段有着比较丰富的细菌多样性,同时存在明显的优势种群结构变化,切胶测序和系统发育分析结果表明,大部分高温阶段优势种群序列与芽孢杆菌属(Bacillus)和梭菌属(Clostridium)中的嗜热菌群具有较近的亲缘关系。研究了餐厨垃圾堆肥高温阶段中真菌和放线菌种群结构,通过微生物总DNA的提取和使用真菌特异性引物对( GC-NS7/NS8 )、放线菌特异性引物对(GC-R513/F243)扩增目标片段,对PCR产物进行DGGE分析和相似性Cs值分析,结果表明:高温阶段餐厨垃圾堆体中真菌、放线菌优势种群明显。高温期真菌经历比较明显的三个阶段,高温期堆体中放线菌生长与真菌生长规律类似。餐厨垃圾堆肥高温期真菌、放线菌DGGE图谱相似性Cs值不高,堆体中真菌、放线菌群落经历了明显的演变过程,群落结构和优势种群具有时序动态性。