非营利组织作为与政府、企业并存的第三部门,在诸如教育、医疗、慈善事业等社会服务领域中扮演着越来越重要的角色。特别是近几年我国自然灾难频发,以中国红十字会为代表的非营利组织在整个抗震救灾过程中弥补了政府工作的空缺,发挥了重要的作用。但是,我国的非营利组织尚未发展成熟中,存在着诸如信息透明度低、工作效率低下、公信力受质疑等问题。绩效审计作为一种有效的外部监督手段,可以有效的改善我国非营利组织的现状,提升组织的绩效水平。目前对于非营利组织绩效审计的研究多停留在理论阶段,缺乏系统深入的理论和实践方法,原因在于绩效审计比一般经济审计难以确定适合的审计目标、合理的评价体系和评价标准。为此,本研究在绩效审计相关理论、非营利组织特征分析以及非营利组织发展现状的基础上,首先从目标层次上确立适合非营利组织绩效审计的审计目标体系,接下来选择非营利组织中具有代表性的中国红十字会作为研究对象,根据中国红十字会应急救援项目的内容,从指标层次上设计绩效审计评价指标体系,通过利用网络上的官方披露渠道收集信息,对应急救援项目的绩效水平进行评价,提出相关对策建议。通过应用,认为所设计的指标体系可以对中国红十字会应急救援类项目的绩效水平做出评价。评价为：中国红十字会应急救援项目的绩效水平较低,具体表现为组织的信息透明度较低,不符合公信力目标的要求；在资金应用中存在支出不合理、利用效率低的问题,不符合经济性目标和效率性目标的要求。由于数据的限制,尚不能对效果性方面的绩效做出评价。