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文冠果为中国北方重要生态和能源树种,内蒙古东部是人工栽培最早和面积最大的地区,也有千余亩集中分布的天然林,对其不同居群间的遗传结构分析具有重要意义。本试验材料选自内蒙古东部主要栽培区的8个不同样地,从形态学角度和分子标记学角度对8个居群的遗传多样性及亲缘关系进行研究,结果如下:(1)对8个居群种子、一年生苗木性状及生物量等的14个指标比较,C-Z-T居群的种子、一年生苗木性状及生物量指标均高于C-Z-R1972居群;X-Q-R1976居群的种皮较厚、种子活力和一年生苗木的苗高、地径、主根长、生物量指标均高于其他居群,幼苗生长最旺盛健硕、根系发达、耐旱性较强;形态特征聚类可为两类,X-Q-R1976居群自成一类,其它7个居群聚为一类,即X-Q-R1976居群与其他7个居群在形态特征差别较大,另外7个居群间的形态特征较为相似。环境对形态特性具有一定影响。(2)天根新型植物基因组DNA提取试剂盒(DP320)提取的DNA,提高了试验效率及安全系数,提取的DNA样本纯净无杂质,在试验过程中无需使用酚/氯仿抽提、操作简单、步骤简便,能在短时间获得后续试验可直接使用的DNA样品;改进CTAB法得到的DNA则样品浓度较高,会产生拖带、连带等现象,且提取过程需使用酚/氯仿抽提、耗时较长、步骤复杂,进行后续实验时需稀释DNA样品。(3)采用试验筛选出13对多态性高、条带清晰、稳定性高的SSR引物,对231份文冠果材料进行扩增,共检测出228个等位基因,各居群的多态位点百分率(P)均为 100%。(4)通过GenALEx6.501分析各居群文冠果的遗传多样性,检测到居群的遗传多样性指标存在差异。T-Z-R1977与C-A-R2010居群的文冠果遗传多样性偏高,C-A-R2007居群的文冠果遗传多样性最低。(5)利用NTSYS聚类软件,对8个居群的231个文冠果个体的SSR-PCR扩增产物图谱进行聚类。在相似系数为0.71处进行分类,可以聚为两类:第一类为C-Z-T与C-Z-R1972聚为一类,其它6个居群聚为第二类;在相似系数为0.73处进行聚类,可以聚为 3 类:C-Z-T 与 C-Z-R1972 为一类,第二类,C-A-R1974、C-A-R2010、C-W-R1973、X-Q-R1976 聚为第二类,C-A-R2007 与 T-Z-R1977 聚为第三类。