目的：观察应用脱细胞异体真皮基质填塞修复高位肛瘘的临床疗效,探讨治疗高位肛瘘的微创治疗新方法。方法：选择我院收治的100例高位肛瘘患者,治疗组采用脱细胞异体真皮基质填塞术,对照组采用传统的肛瘘低位切开并高位挂线术,比较两组手术时间、术后疼痛视觉模拟评分、术后疼痛持续时间、术前及术后肛门失禁程度评分、术后并发症、创面愈合时间、住院时间、一期手术成功率、治愈率、复发率。结果：治疗组手术时间、术后疼痛视觉模拟评分、术后疼痛持续时间、术前及术后肛门失禁程度评分、创面愈合时间、住院时间均低于对照组(P<0.05),一期手术成功率及治愈率高于对照组(P<0.05),两组在复发率的比较、术后并发症的比较上,差异无显著性意义(P>0.05)。结论：脱细胞异体真皮基质填塞修复高位肛瘘的治疗,在降低高位肛瘘复发率、减少术后并发症方面与传统低位切开并高位挂线术方面基本一致；在减轻患者疼痛、促进创面愈合、减少住院疗程、降低对肛门功能及外观的损害、提高治愈率方面具有较为显著优势,可进一步在临床中推广应用。