高职院校的专业设置是连接社会需求与教学工作的桥梁,是学校教育教学工作主动适应社会需求的关键环节。专业设置的合理与否关系到高职院校所培养的人才能否更好的适应社会经济对人才的需求,同时也关系到高职院校的办学特色和整体办学水平。本文首先讨论要研究的问题、研究的必要性及意义、研究思路及研究方法。从高等职业教育专业及其概念入手,考察高职院校与普通高校在专业设置上的异同。然后,阐述了高等职业教育专业的特点、影响因素及专业设置的原则等专业设置的理论。接着通过文献资料法、比较法等对福建省高等职业教育专业设置的各阶段进行了梳理和分析,总结了福建省高等职业教育专业设置的阶段性特征与问题,并重点对2009年福建省57所高职院校当前专业设置情况进行了研究,分析了福建省高等职业教育专业设置过程中出现的问题及其产生的根源。最后,在前面理论分析的基础上结合福建省高等职业教育专业设置的实际,提出了相应的对策。