二花脸×沙子岭F2近交群体中有部分初生仔猪表现为外耳畸形,这是由于Hoxa1基因发生了c.451G>TC突变所导致的,本试验旨在研究全反式维甲酸修复Hoxa1^-/-基因型胎猪外耳畸形的可行性。本研究用一头性欲良好的Hoxa1^+/-基因型公猪分别与24头体重和膘情相近且均为第一胎的Hoxa1^+/-基因型母猪交配,将24头妊娠母猪随机分成对照组（6头）和试验组（18头）。对照组母猪配种后饲喂基础日粮,试验组采用3×3双因素有重复方差设计,即母猪在妊娠第12、13、14天,每个时间点按4、5、6mg/kg体重补饲全反式维甲酸（ATRA）一次,每个时间点每个剂量2头妊娠母猪。所有仔猪出生当天,立即对仔猪左右外耳拍照评分、称重、采集血清、耳朵组织、空肠内容物,用于相关指标的测定。试验一:对试验组畸形耳仔猪和对照组正常、畸形耳仔猪分别进行左右外耳评分、称重和血清炎性因子（IL-6、IL-8、TNF-α、IFN-γ）测定,结果表明,ATRA的饲喂时间对Hoxa1^-/-基因型仔猪左右外耳得分、体重有显著影响（P﹤0.05）,但饲喂剂量和饲喂时间与饲喂剂量互作对Hoxa1^-/-基因型仔猪左右耳得分、体重影响不显著（P﹥0.05）。ATRA的饲喂时间对Hoxa1^-/-基因型仔猪血清IL-6、IFN-γ含量有显著影响（P﹤0.05）,IL-8、TNF-α含量不显著（P﹥0.05）,但饲喂剂量和饲喂时间与饲喂剂量互作对Hoxa1^-/-基因型仔猪血清IL-6、IFN-γ、TNF-α、IL-8含量影响不显著（P﹥0.05）。母猪妊娠期第14天饲喂4mg/kg体重的ATRA:（1）仔猪的外耳具有很好的修复效果;（2）仔猪的体重更接近正常仔猪体重;（3）仔猪的血清炎性因子（IL-6、IL-8、TNF-α、IFN-γ）含量更接近正常仔猪。试验二:在试验一结果的基础上进行,选取母猪妊娠期第14天饲喂4mg/kg体重ATRA的仔猪空肠内容物,及对照组仔猪空肠内容物,进行16S r DNA的V3+V4区的肠道微生物测序,结果表明:在本次实验条件下可能与耳朵发育、体重和4种炎性因子（IL-6、IL-8、IFN-γ、TNF-α）正相关的菌群有4个:厚壁菌门（Firmicutes）、乳酸杆菌（Lactobacillus）、Clostridium＿sensu＿stricto＿1、韦永氏球菌属（Veillonella）;负相关的菌群有3个:变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、Patescibacteria。试验三:在试验一、二结果的基础上进行,选取母猪妊娠期第14天饲喂4mg/kg体重ATRA的仔猪血清,及对照组仔猪血清,进行非靶向代谢组检测,结果表明:初生仔猪的血清差异代谢物及代谢通路都繁多复杂,初步认为精氨酸生物合成通路和ABC转运蛋白通路可能与耳朵发育密切相关。本研究发现:Hoxa1^-/-基因型猪的外耳出现畸形、体重偏低及血清炎性因子（IL-6、IL-8、TNF-α、IFN-γ）偏低,Hoxa1^+/-基因型妊娠母猪第14天补饲4mg/kg体重的全反式维甲酸对Hoxa1^-/-基因型初生仔猪的影响:（1）初生仔猪的外耳具有较好的修复效果;（2）初生仔猪的体重具有较好的提高效果;（3）初生仔猪的血清炎性因子（IL-6、IL-8、TNF-α、IFN-γ）具有较好的改善效果;（4）与耳朵发育、体重和4种炎性因子（IL-6、IL-8、IFN-γ、TNF-α）正相关的菌群有4个:厚壁菌门（Firmicutes）、乳酸杆菌（Lactobacillus）、Clostridium＿sensu＿stricto＿1、韦永氏球菌属（Veillonella）;负相关的菌群有3个:变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、Patescibacteria。（5）初生仔猪的血清差异代谢物及差异代谢通路较多,初步认为精氨酸生物合成通路和ABC转运蛋白通路可能与耳朵发育密切相关。