SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌术前分期中的应用

来源 :第二军医大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:fanxingyi
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的准确的术前分期对指导结直肠癌的个体化治疗有重要意义,肿瘤分期及淋巴结分期是临床病理分期的主要内容,本研究旨在利用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)发现结直肠癌Ⅰ期及淋巴结分期特异蛋白质,建立结直肠癌Ⅰ期诊断及淋巴结分期血清蛋白质分类树模型,进而指导结直肠癌的个体化治疗及预后评估。方法应用SELDI-TOF-MS和固化金属螯合(immobilized metal affinity capture,IMAC30-Cu2+)蛋白质芯片检测血清样本245例(其中结直肠散发性中分化腺癌210例、正常人16例及结直肠良性病19例)得到血清蛋白质谱图,利用Biomarker Wizard软件进行蛋白峰值鉴定和聚类。应用Biomarker Wizard软件及Biomarker Pattern软件分析结直肠癌Ⅰ期患者31例与非癌组样本35例(正常人16例及结直肠良性病19例)得到结直肠癌Ⅰ期特异蛋白质,建立结直肠癌Ⅰ期诊断分类树模型,在测试模式下评价其诊断效率,另外,应用酶联免疫法检测样本CEA做为对照,比较结直肠癌Ⅰ期分类树模型与CEA的灵敏度、特异度;将210例结直肠癌患者分成训练组和测试组(训练组包括伴区域淋巴结转移者70例和年龄性别相匹配无区域淋巴结转移者75例,测试组包括伴区域淋巴结转移者35例和年龄性别相匹配无区域淋巴结转移者30例),应用Biomarker Wizard软件及Biomarker Pattern软件分析训练组,得到结直肠癌淋巴结分期特异蛋白质,建立结直肠癌淋巴结分期分类树模型,以测试组样本进行独立样本的双盲验证。结果对结直肠癌Ⅰ期患者31例与非癌组样本35例(正常人16例及结直肠良性病19例)分析,BioMarker Wizard软件识别了61个质峰,其中质荷比(M/Z)为5,828等9个蛋白差异有显著性(P<0.005),BioMarker Pattern软件分析结果显示由质荷比为2,787、3,777、3,816、3,852、5,065、5,828、5,855和4,172等8个蛋白质构成的结直肠癌Ⅰ期诊断分类树模型可以有效鉴别结直肠癌Ⅰ期与非癌组,在学习模式下灵敏度和特异度分别是93.55%及91.43%,在测试模式下灵敏度、特异度和阳性预测值分别是70.97%、82.86%及78.57%,显著优于CEA(P<0.05)。分析70例伴区域淋巴结转移的结直肠癌患者和75例年龄性别相匹配无区域淋巴结转移的结直肠癌患者血清蛋白质组,Biomarker Wizard软件识别了46个质峰,其中质荷比为5,867等22个蛋白差异有显著性(P<0.05),由质荷比为3,104、3,781、5,867、7,970、9,290等5个蛋白质构成的结直肠癌淋巴结分期分类树模型可以有效鉴别结直肠癌患者伴或不伴区域淋巴结转移,灵敏度和特异度分别是94.29%及100.00%,以测试组样本进行独立样本的双盲验证,其灵敏度、特异度及阳性预测值分别是96.67%、91.43%及90.63%。结论结直肠癌Ⅰ期患者与非癌组血清中有9个蛋白质含量差异显著,伴区域淋巴结转移者与不伴局域淋巴结转移者血清中有22个蛋白质含量差异显著,它们在结直肠癌Ⅰ期及淋巴结转移过程中过程中高表达或低表达,为结直肠癌的术前分子分期提供了潜在标志物。SELDI-TOF-MS检测得到的血清蛋白质组结直肠癌Ⅰ期诊断分类树模型可以准确鉴别结直肠癌Ⅰ期患者与非癌组样本,对结直肠癌Ⅰ期的筛查有重要意义,结直肠癌淋巴结分期分类树模型可以准确鉴别结直肠癌患者伴或不伴区域淋巴结转移,对结直肠癌术前淋巴分期有重要意义。
其他文献
在食品包装设计过程中,色彩的合理运用对于其销量有着重要的影响。在食品包装设计过程中,需要考虑到消费大众的人群特点,选择合适的色彩进行设计,能够极大地提高商品的知名度
微生物发酵是改善豆粕营养成分的有效手段,但发酵进程中微生物水平的变化和相关影响尚缺乏足够研究。通过添加外源乳酸菌(屎肠球菌),研究豆粕72h发酵进程内,菌群和蛋白水平的
一、企业资金渠道的变化社会主义企业的各种运动可以表现和归结为资金运动。资金是企业进行简单再生产和扩大再生产的前提条件;资金是企业生产经营活动的出发点和归宿点;资金
随着数字信息技术的发展,数字化、网络化教学资源逐渐呈现,教育教学资源共享平台在教育上得到了广泛应用。利用现代高新技术进行教育教学资源的共享与优化配置,成为当前教育
<正>慢性肾功能衰竭患者在维持性血液透析过程中,由于透析技术的不断提高,死于尿毒症本身的已明显减少,威胁他们生命的常常是心脑血管疾病,心脑血管疾病已成为慢性肾功能衰竭
会议
永久散射体干涉测量技术(PSInSAR)地表形变监测能力受限于稳定散射体的空间分布密度,在PS点稀疏的非城区不再有效。本文基于临时相干目标(temporarily coherent targets,TCT)
针对某航天器产品总装、电测、内外场试验期间需要多姿态频繁拆装舱内设备的特点,设计了一种多姿态使用、多工位集成的智能装备。提出了采用特殊形状翻转架与自动化翻转架车
目的:不同浓度的IP6作用于人结肠癌细胞系HT-29,观察IP6对癌细胞分化的影响,并对其机制进行探讨。方法:将不同浓度的IP6(对照组,1.8 mM,3.3 mM)作用HT-29细胞不同时间(1d,3d,5d),
按照市委统一部署,市人大常委会党组11月24日召开中央巡视组巡视“回头看”反馈意见整改落实专题民主生活会,深入学习贯彻党的十八届六中全会精神和习近平总书记系列重要讲话
对分离自吉林省主要参场的软腐病参根和厌气诱发产生软腐症状的参根的菌株进行了致病性测定、电镜形态观察和生理生化测定等。结果表明,造成吉林省人参细菌性软腐病的病原种