2017年底,原国家卫计委等多部门联合印发《关于加快推进三级公立医院建立总会计师制度的意见》,提出到2018年底前,全国所有三级公立医院全面落实总会计师制度。关于预算绩效管理工作的开展,有关部门已经于2018年9月份做出了具体的要求,提出了应该注重管理的“全面性”和管理“绩效”的意见,并对全面开展预算绩效管理工作做出以下安排:建立全面规范透明、标准科学、约束有力的预算制度,要求提高资金使用效率,避免资金浪费。作为医改的重要组成部分,现代公立医院管理制度明确要求建立健全全面预算管理、成本管理、财务报告,逐步实行医院全成本核算。放在更为广阔的历史背景中加以考察,中国特色社会主义初级阶段的基本矛盾是公立医院财务制度改革的逻辑起点;事业单位改革是新时代全面深化改革一个重要领域;公立医院财务制度改革又是事业单位改革当中的一个关键环节。公立医院改革势在必行,其中,财务制度运行机制改革成为啃下这块“硬骨头”的一个突破口。财务制度的运行管理过程中涉及的内容和项目十分宽泛。过去的研究着眼点往往放在了公立医院财务制度如何运行,以及如何降低预算和怎样做好绩效管理等问题上。本研究将基于财务管理规范角度,总结出当前公立医院实行的财务制度规范中存在的不足之处,对新时代公立医院财务制度运行机制的优化与改革进行研究,为我国新时期公立医院财务工作有效开展提供理论支持。本文根据国内公立医院实际运营管理情况,对预算管理工作、成本核算项目及绩效考核工作的开展提出看法,并就国内公立医院运营发展的实际情况制定具体的改革办法和方案。主要包括优化全面预算各个环节的相关办法,全成本核算作业的具体措施,绩效考核标准确立以及风险内审模式的选择等等。通过本文的分析希望能够为国内公立医院财务管理机制的优化改革提供参考,以彰显我国公立医院公益性和福利性这两大特点,促进政事、管办、医药相互独立的管理体系的形成,在实现公立医院经济效益的同时,不断提高其社会效益。