新一轮医药卫生体制改革的启动,给处于农村卫生三级医疗、预防、保健网络枢纽地位的乡镇卫生院指明了发展的方向,提供了新的机遇。乡镇卫生院作为实现人人享有初级卫生保健宏伟目标的重要依托,是开展农村社区卫生服务、新型合作医疗、乡村一体化管理的中心。本文以乡镇卫生院作为研究的切入点进行实证调查,真实的反映了现行基层医疗卫生服务体系中存在的主要问题和缺失,继而提出了更快更好的完善发展乡镇卫生院的建议对策,对进一步健全基层医疗卫生服务体系、促进基本公共卫生服务逐步均等化、尽快提高农村牧区医疗水平有一定的理论和实际意义。研究显示X盟乡镇卫生院存在卫生资源配置结构不合理,卫生投入不足业务能力有限,人才匮乏总体素质不高,卫生院管理不规范负债经营,发展方向不清,医药改革限制多,乡村一体化管理流于形式等主要问题,基于这些问题本文深入分析了影响乡镇卫生院发展的深层次原因,即医疗卫生作为一种混合公共物品,是市场与政府双失灵的领域,我国在医药卫生体制改革前期出现了过分市场化的错误,后期政府的公共职能定位又发生了偏差,出现公共部门在提供公共物品以及公共服务的同时存在浪费和滥用资源以及投入不足两种情况,导致公共支出虽然逐年加大但效率却依然低下,改革效果甚微。同时医疗保障作为促进医药卫生事业发展的重要角色,尚未达到一定的保障水平,对医药卫生体制改革没有发挥出其应有的促进作用也是医改多年效率低下的重要原因之一。最后本文从人才培养机制、医疗服务模式、内部运行机制、资源分布结构以及完善新型农村合作医疗等方面提出了新形势下改革和发展乡镇卫生院的思考和建议,以期为基层牧区居民更好的就医尽一点绵薄之力。