本文中我们以sGC-HNOX结构域为研究对象,就以卟啉为核心的sGC活性调节机理相关的主要问题进行了详细的理论研究。本文的主要研究内容为:①对HNOX结构域家族成员进行性质分类和序列比对分析,采用同源模建方法构建sGC-HNOX结构域模型,并对模型进行了优化和筛选,最终确立了sGC-HNOX结构域的同源模型;②基于我们构建的sGC-HNOX结构域模型,利用分子动力学和主成份分析等方法探讨Y-S-R基序在sGC-HNOX结构域中与蛋白质结构稳定性的具体关系;③通过分子动力学、量子化学计算等方法对sGC-HNOX结构域中Leu104和Leu108控制水分子进出卟啉口袋的动力学行为进行了分析,结果表明卟啉近端水分子可能与配位键Fe-His的断裂相关;④通过分子动力学、主成份分析等方法就配位键Fe-His断裂引发的sGC-HNOX结构域的主要响应进行了详细研究,证明了L2的构象变化是sGC-HNOX结构域对配位键Fe-His断裂的主要响应,激活信号在能量的驱使下被传递到了L2,并引起了L2的构象变化。我们从sGC的调节结构域出发,对sGC活性调节机理中涉及到的具体问题给出了理论解释,我们的结果和理论数据也为未来sGC活性调节机理的理论和实验研究提供了参考和依据。