孵化器在其产生和发展的历程中,已经被证明是一种促进技术成果商业化和科技企业成长的有效的政策工具,在帮助新创企业克服初创阶段所面临的各种困难、提高初创企业存活率、增加就业并推动国家和地区经济发展的过程中扮演着越来越重要的角色。科技企业孵化器已经成为国家创新体系的重要组成部分,是大学和科研机构社会职能的延伸。但长期以来,有关孵化器运行效率的定量研究仍然很缺乏,如何更加客观地、准确有效地衡量企业孵化器的运行效率,一直是一个悬而未决的命题。因此,研究我国中部地区科技企业孵化器运行效率,对于促进我国中部地区经济发展、构建和谐社会有着深远的意义。本文以孵化器运行绩效评价为“切入点”,通过DEA-BCC模型测算了中部地区科技企业孵化器运行效率的综合效率以及规模效率、投入与产出的冗余与松弛状况,研究结果表明:我国中部地区科技企业孵化器的整体运行效率较低,孵化器管理部门在注重科技企业孵化器的投资和规划时应该更多考虑投入产出的效率,应该大力改善孵化器管理和资源配置的水平,从而提高投入要素的利用效率。通过利用超效率模型和灰色关联分析法,进一步实证分析影响孵化器自身运行效率的相关因素发现发明专利数量是影响孵化器效率的关键因素。