【摘 要】
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目的:噬菌体是寄生于细菌等微生物体内的一类病毒,最简单的噬菌体只有十余个基因,最复杂的噬菌体有数百个基因.展开对噬菌体基因组学以及功能基因组学的研究,对于探讨生物的
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目的:噬菌体是寄生于细菌等微生物体内的一类病毒,最简单的噬菌体只有十余个基因,最复杂的噬菌体有数百个基因.展开对噬菌体基因组学以及功能基因组学的研究,对于探讨生物的多样性,深入了解生命起源、生物进化、遗传变异、基因调控、生化代谢等许多重要生命现象有着极为重要的意义.因此,噬菌体的研究成为近年来的一个热点领域.该研究室前期的工作已经完成了噬菌体PaP3的全基因组测序,弄清了该噬菌体为线性双链DNA,全基因组由44,249bp组成,具有247个(大于100 bp)ORFs,基因预测分析提示有69个ORFs可能是编码基因,其中有6个ORFs分别编码解旋酶、两个DNA聚合酶、核酸外切酶、终止酶大亚单位和溶菌酶.除上述6个ORFs外,其余均是功能尚不清楚的新基因.这些预测是根据现行常用生物信息学分析软件的分析结果.这些计算机分析结果最终还是需要实验证据来证实.比如,在噬菌体PaP3基因组发现的69个ORFs中,哪些可能是真正的基因?如果是基因,它们的功能是什么?这些问题,最终都只能用实验证据来回答.该研究旨在上述工作的基础上,拟从mRNA表达水平和蛋白质表达水平入手,证明哪些ORFs可能是真正的基因.希望能为该噬菌体的基因组学、功能基因组学及今后可能开展的工程改造奠定一定基础.
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