马蹄参(Diplopanax stachyanthus Hand.-Mazz.)隶属于五加科(Araliaceae)马蹄参属(Diploppanax Hand.-Mazz.).该种被列为国家II级重点保护植物和活化石植物,对研究古地理和古气候以及五加科和山茱萸科的系统发育具有重要意义,为了更好地保护这种珍稀濒危植物,本文利用SSR标记,首次对该种植物进行保护遗传学研究。主要研究结果如下：(1)采用改良FLASCO法开发SSR引物,最终获得51个重复序列,用软件进行引物设计后共得到34对引物；(2)从9个马蹄参自然居群中各选取3个个体,对34对引物进行筛选,共筛选出对全部DNA模板有清晰、稳定扩增产物的14对引物,其中10对是多态的,4对是单态的；(3)利用10对多态引物对马蹄参的9个自然居群共169个个体进行遗传多样性分析,结果表明：马蹄参具有较高的物种水平遗传多样性(NE=5.03,HE=0.776,I=1.730)和居群水平遗传多样性(NE=3.06,HE=0.617,I=1.198)；(4)Nei’s遗传多样性分析和AMOVA分析表明,马蹄参具有中等偏低的居群间分化,遗传变异主要存在于居群内(FST=0.178),居群间基因流较大(Nm=1.431)；(5)聚类分析和主成分分析一致支持9个马蹄参自然居群分为两大支；Mantel相关性检验表明马蹄参居群的遗传距离和地理距离间存在着显著相关性(r=0.478,P<0.05)。基于马蹄参的遗传多样性现状和自身的生物学特征,本研究认为马蹄参的保护应保护有效居群大小和限制人为破坏活动为主。图10幅,表8个,参考文献105篇。