本文在前人研究的基础之上,从系统论的角度来研究区域知识经济的发展状况,论文提出了区域知识经济系统的概念,对区域知识经济系统功能的内涵进行了解析,并将系统功能的影响因素划分为系统要素、系统结构、系统环境。基于“要素-结构-环境-功能“的逻辑模型构建了指标体系,选取1999-2011年西部地区11个省份的数据,对西部地区知识经济系统现状进行了分析,而后利用主成分分析法对数据进行降维处理,并对西部地区知识经济系统的功能、要素、结构、环境进行了整体评价。利用主成分分析结果运行结构方程模型,得到了要素、结构、环境对功能的影响程度和它们之间的相关性。基于结构方程的实证研究发现：我国西部地区知识经济系统功能主要是靠要素和环境进行驱动,而系统结构对功能的影响程度很小,这说明西部地区知识经济系统结构还处于低层次的结构,影响了西部地区知识经济系统功能的发挥,而且结构与要素、结构与环境之间的相关系数也较小,并没有形成相互促进的局面。最后,文章提出了强化西部地区知识经济系统功能的政策建议,保持经济产出功能、社会功能的发挥,强化创新功能;加大要素投入,做好招商引资工作,加大人力资本和信息技术设施的投入；进一步夯实经济基础,优化外部环境,加大政府支持力度；加大知识产业的发展力度,优化市场结构。