当今市场竞争越来越激烈,竞争格局也由简单的企业与企业之间的竞争上升到供应链与供应链之间的竞争。同时,越来越多的现实案例表明,企业只有从事突破性技术创新,才能在当今国际化市场环境下构建自身的核心竞争力。与此同时,单个企业已经无法满足突破性技术创新所需要的资源和技术,寻求合作伙伴共同从事突破性技术创新活动已是大势所趋。本文将供应链管理和突破性技术创新两者有机的结合起来,以达到选择合适的供应链合作伙伴共同从事突破性技术创新活动的目的。本文在梳理了大量国内外研究的情况下,按照三阶段法,即评价指标体系的构建一合作伙伴的初选—合作伙伴的精选构建了一个合理的伙伴选择模型。首先在评价指标体系阶段,综合分析现有文献中对突破性技术创新等方面的影响因素,提选出海选指标,综合应用隶属度分析、因子分析法、AHP和资源约束模型,构建了本文的评价指标体系；其次在伙伴初选阶段,结合聚类分析法和Kraljic经典分类模型,把大量的候选伙伴分成4类,达到降低解空间的目的,提高最终决策的效率；最后在伙伴精选阶段,结合前文建立的评价指标体系和AHP对每个指标赋权重,再结合评价对象自身的评价值,就可以算出候选伙伴的最终得分值,选取到最佳的合作伙伴。与此同时,通过结合经典事例,演示了本文三阶段中每一个阶段提出的方法和得到的模型都可以很好地应用到实际商业决策中,表明本文提出的突破性技术创新综合供应链伙伴选择模型具有实际意义。