CEM15基因的生物信息学分析

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最近,对Vif 的研究揭示了自然免疫的新成员—APOBEC3G(CEM15),它是胞苷脱氨酶,作为反转录元件起致死性突变反转录病毒的作用。APOBEC3G 属于APOBEC 家族成员,以DNA 编辑的方式抑制反转录病毒复制,如HIV-1。APOBEC3G 是广谱的抗病毒蛋白,对HBV 也有强烈的抑制作用,但是作用机制有所不同。APOBEC3G(CEM15)是一种抑制HIV-1 感染的细胞内蛋白,在病毒复制晚期被整合进子代病毒粒子,继而引发反转录病毒cDNA 负链大量的dC-dU突变。Vif 是HIV-1 自身编码的附属蛋白,在HIV-1 复制过程中起重要作用。Vif 的表达对产生病毒的细胞是必需的,若没有Vif,下一个靶细胞的感染就会因固有抗病毒机制的作用而结束。Vif 蛋白有两个结构域,其中一个结合到APOBEC3G,另一个负责分解APOBEC3G,称为SLQ(Y/F)LA 基序。Vif 利用泛素-蛋白酶体降解途径使APOBEC3G 迅速降解。CEM15 基因的发现具有重要意义,它开辟了治疗AIDS 的新途径。但人们对它的了解并不多,所以有必要对其进行详细的分析。本文运用生物信息学方法对该基因的电子表达谱、染色体定位、相应蛋白的物理化学性质进行了分析,并进行了结构和功能预测。全文的内容有如下几点: 1)对CEM15(APOBEC3G)的发现和功能,以及其作用机制进行了详细的概述。2)运用INTERNET 上的生物信息学资源,从基因水平分析CEM15的各种特性。3)分析CEM15 基因表达蛋白APOBEC3G。4)对各物种CEM15(APOBEC3G)进行序列比较,并构建了系统发育树。5)利用GenBank 数据库中的EST 序列,电子克隆了与小鼠CEM15基因同源的牛的CEM15 基因。
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