谷子是我国重要的粮食作物,质量和产量是现今农业生产中十分重视的问题。谷子病害是影响谷子生产和品质的主要问题,所以防治谷子病害具有很重要的意义。谷子白发病是阻碍谷子产业发展的主要病害之一。谷子白发病的病原菌是一种专性寄生菌,为禾生指梗霉(Sclerospora graminicola)。本研究采集了来自不同谷子产区的128份谷子白发病菌为试验材料,利用PCR分子检测技术,对白发病菌的遗传变异进行了研究。以140份不同地理来源的谷子品种为试验材料,采用人工接种技术,进行了不同品种的白发病抗性鉴定。并在140份具有抗感品种的试验材料中挑选出4个高抗品种和5个感病品种,利用宏基因组技术,对谷子抗感品种内生细菌进行功能分析。得出以下结果:(1)白发病菌的28S r RNA序列随着地区的不同,序列也会发生变化。根据Gen Bank数据库中白发病菌的28S r RNA序列,设计出了7对谷子白发病菌的特异性引物,筛选出具有特异性的引物28S-170 F2/28S-1530 R2,用其对128份谷子白发病病菌样品基因组DNA进行PCR扩增。该引物可扩增出1360 bp的目标片段,将扩增测序后的结果与白发病菌的28S r RNA序列比对,得到白发病菌基因种内多态性位点有172个,其中有1个多变异位点,多态性位点多为A-G之间的转换。128份样品中检测出有92种单倍型,SG6单倍型出现次数最多,为优势单倍型,山西、贵州、河北地区的白发病菌都含有SG6单倍型。(2)谷子白发病抗性等级调查,对140份人工接种白发病菌的谷子品种进行调查,发现抗性等级为1(高抗)的有8个品种,抗性等级为3(抗病)的有37个,抗性鉴定等级为5(轻感)的有77个,抗性鉴定等级为7(感病)的有18个,无抗性鉴定等级为9的高感品种。(3)采用宏基因组技术对谷子白发病抗感品种的内生细菌进行了群落以及功能分析。不同品种以及不同部位之间所含有的内生细菌群落存在差异。经宏基因组测序得到的基因序列与KEGG数据库对比,KEGG功能注释结果显示,功能基因主要分布在Metabolism的膜运输(Membrane Transport)和氨基酸代谢(Amino Acid Metabolism)上。经比较发现,G3(茎)和G5(抽穗期穗)这两个分组的微生物群落功能占比高于其他分组,G1(叶)、G4(叶鞘)、G6(成熟期穗)的功能占比要小于其他分组样品。本研究鉴定分析了不同地理来源的谷子白发病菌遗传多样性,进行了不同品种的谷子白发病的抗性鉴定,挑选出抗感品种利用宏基因组技术分析其不同时期不同部位的内生细菌,对今后谷子抗病育种提供了基础资料。