为建立与社会主义市场经济体制相适应的公共财政体系,财政部近年来进行了部门预算、政府采购和国库集中支付制度为主的财政管理体制改革,这些改革措施对教育财务会计的理论和实务带来深刻的变化并产生巨大的影响。现行高校财会制度不仅严重滞后于新的财政管理体制,也因高等教育管理体制改革的深入而使现行高校财会制度存在的问题和弊端日益显露出来。因此,制定一套与新的财政管理体制相适应、符合我国高等学校财务会计工作特点和管理需要的新的高等学校财务会计制度,以指导高等学校财务会计实践,就成为当前教育财务会计界的一项迫切任务。基于上述认识,本文以市场经济体制下公共财政建设为背景,以部门预算改革为主线,深入分析和探讨了部门预算及其相关配套改革措施对高校财务预算和会计工作的影响,提出了适应部门预算改革,强化高校财务会计工作的若干对策及改革建议。