IKZF1基因缺失与儿童急性淋巴细胞性白血病临床及预后关系的回顾性分析

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目的:研究IKZF1基因缺失与儿童急性淋巴细胞性白血病(Acute lymphoblasticleukemia,ALL)患儿临床生物学特征及预后的关系。方法:回顾性选取不同临床危险分型的181例ALL患儿,采用AccuCopy多重基因拷贝数检测技术检测IKZF1基因启动子及外显子缺失情况,如检出存在IKZF1基因启动子、8个外显子的任何一个功能序列的缺失,则代表存在IKZF1基因的缺失。统计分析IKZF1基因缺失率和不同功能序列缺失谱与ALL患儿染色体、MRD、融合基因(BCR/ABL1及MLL基因重排)等临床特征及预后的关系。结果:1.IKZF1基因的缺失率及不同功能序列的缺失谱1.1IKZF1基因缺失率181例初诊ALL患儿检出IKZF1基因缺失33例,缺失率为18.23%。其中83例高危组患儿中有25例IKZF1基因缺失,占30.12%;98例低中危组患儿中有8例IKZF1基因缺失,占8.16%;27例伴有BCR/ABL1融合基因患儿中有12例IKZF1基因缺失,占44.44%;49例复发患儿中有18例IKZF1基因缺失,占36.73%。1.2.IKZF1基因不同功能序列的缺失谱33例IKZF1基因缺失患儿中,包含启动子的全基因单拷贝缺失:14例(42.42%),4-7外显子单拷贝缺失:11例(33.33%),启动子及4-7外显子双拷贝缺失:4例(12.12%),2-3外显子单拷贝缺失:4例(12.12%),其中以启动子序列的缺失比例最高。2.IKZF1基因缺失的临床生物学特征根据卡方检验,IKZF1基因缺失率在患儿的不同性别组、强的松预处理敏感与否组、是否存在MLL基因重排组和不同染色体核型组间差异无统计学意义(χ2分别为0.800,0.004,0.355和8.000, P值分别为0.442,0.624,0.400和0.238),而在融合基因BCR/ABL1阳性组显著高于阴性组(χ2为14.626, P为0.001)、33天MRD>1x10^-4组显著高于MRD≤1x10^-4(χ2为14.645, P为0.001)。根据Wilcoxon秩和检验,两两对照,IKZF1基因缺失率在年龄大于2岁(Z为2.749,P为0.006),初诊分层高危组(Z为1.993,P为0.046)、初诊白细胞大于50x10^9/L(Z为1.964,P为0.049)差异有统计学意义。3.IKZF1基因缺失与预后的关系3.1181例ALL患儿中根据IKZF1基因缺失与否分为缺失组与未缺失组,分别占18.23%和81.77%,其预期五年生存率分别为42.5%、66.5%,Log-rank检验χ2为3.970,P为0.046(P<0.05)。两组预期生存率差异具统计学意义,缺失组明显低于未缺失组。3.2IKZF1基因不同功能序列缺失谱与预后的关系IKZF1缺失谱以启动子缺失为主,其次是4-7外显子单拷贝缺失,启动子的全基因单拷贝缺失与4-7外显子单拷贝缺失预期五年生存率分别为14.0%、37.4%,Log-rank检验χ2为0.226,P为0.634(P>0.05),两组间预期五年生存率差异无统计学意义。3.3IKZF1基因缺失与复发的关系181例初诊患儿中基因缺失组有33例,其中复发18例(54.50%),未复发15例(45.50%),基因未缺失组有148例,其中复发31例(20.95%),未复发117例(79.05%),两组患儿对复发存在明显差异(χ2为15.429,P为0.000)。33例IKZF1基因缺失的患儿中复发18例(54.50%),未复发15例(45.50%),其预期五年生存率分别为8.7%、93.3%,Log-rank检验χ2为12.019,P为0.001。结论:1.本组ALL患儿IKZF1基因缺失率为18.23%左右,其序列缺失以包含启动子的缺失为主;IKZF1基因不同功能序列缺失谱不是影响ALL患儿预后的主要因素。2.性别、强的松预处理效果、MLL基因重排和染色体核型不是影响IKZF1基因缺失与否的主要因素; IKZF1基因缺失在33天MRD>1x10^-4、BCR/ABL1融合基因阳性、年龄大于2岁、初诊白细胞大于50x10^9/L患儿中明显高发,与初诊危险分层高危组因素明显相关。3.IKZF1基因缺失是影响ALL患儿复发的一个不良因素,也是影响其生存率的重要因素,可能作为一个独立的危险分层因素。
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