雅鲁藏布江-布拉马普特拉河是流经中国、印度、不丹和孟加拉国的重要国际河流。至今,流域4国在水资源利用与管理上未能实现有效的合作,各国均依照自身需求与目标对水资源进行利用和管理,不利于跨境水资源的可持续目标的实现。因此,为推进该流域的合作,需要了解和认识4国水资源管理体制及其差异,为探讨建立跨境河流水合作机制打下基础。基于对“国家水资源管理体制”的理解,构建4个流域国水管理部门“设置-职能-运行”分析框架,利用流域国的水资源管理目标、法律法规和政府网站信息,认识流域4国的水资源管理体制,分析其差异。主要结论如下:（1）流域国水管理部门设置纵向差异明显。受用水目标和政治制度影响,中国中央和地方水管理部门设置相同,印度的联邦和邦水管理部门独立并行,不丹多部门参与的国家环境委员会并辐射地方,孟加拉国中央水部门更多的是直接管理地方水事务。（2）流域国水管理部门职能差异取决于各国在水资源管理上中央集权程度、法律或行政授权。中国水资源管理为中央统管、地方分管,水利部门主管、其他部门协管,流域机构职能偏向于技术支持;印度两级政府职能两足鼎立,流域机构负责协调邦际用水;不丹水管理职能集中于中央,地方部门仅是中央机构的分支或代理,流域机构职能小;孟加拉国水管理职能集中于中央,地方政府职能模糊、权力有限,流域机构参与跨境河流管理但无实权。（3）流域国管理部门间运行差异体现在各国水管理部门间的决策过程及实施程序上。中国呈“多龙管水”格局、运行复杂,中央决策、地方支持但有一定自主权;印度两级政府为指导和协作关系;不丹由国家环境委员会决策、其他各部门协作;孟加拉国由中央决策,部门之间缺乏监督和协调。（4）受到不丹没有外交自主权、中印和印孟水合作基础薄弱、以及流域各国水资源体制差异的影响,目前建立流域4国间跨境水合作机制不现实,但可加强双边合作。