【摘 要】
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DNA分子作为生物界中的重要遗传物质,其性质一直以来都备受关注。目前实验表明,诸如温度、拥挤效应对DNA分子相关性质影响显著。例如,温度升高能够促进DNA凝聚,拥挤效应可以
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DNA分子作为生物界中的重要遗传物质,其性质一直以来都备受关注。目前实验表明,诸如温度、拥挤效应对DNA分子相关性质影响显著。例如,温度升高能够促进DNA凝聚,拥挤效应可以直接导致DNA凝聚。但是温度对DNA凝聚促进作用的机制及拥挤效应对高价反离子导致的DNA凝聚过程影响均有待于进一步认识。鉴于此,利用蒙特卡洛模拟方法,开展以下工作:(1)温度对DNA分子凝聚过程的影响。将温度对DNA分子驻留长度的影响整合到DNA分子凝聚的强关联模型中,探究温度对DNA凝聚单分子实验过程的影响,得到与单分子实验吻合的结果。拉力较小时,DNA发生凝聚过程,随着温度升高DNA凝聚越来越紧凑。(2)在de Gennes和Odijk交叉区域系统地研究了拥挤效应对DNA凝聚过程的影响。利用DNA凝聚强关联模型表征DNA分子,与球状粒子受限于形状因子不同的受限空间,结果表明,拥挤效应显著促进DNA凝聚过程,球形受限的情况下,随着球形粒子体积分数增加,DNA分子由最初的线团状态逐步凝聚为面包圈结构,进一步转变为棒状结构,最后完全凝聚,而且临界体积分数与球形粒子直径呈正比;随着形状因子增加,在胶囊形受限体系中,拥挤效应对DNA凝聚的促进作用较为复杂,一旦形状因子大于1.6,随着体积分数的增加,DNA由完全凝聚状态逐渐转变为棒状结构,主要源于球形粒子重排,导致实际受限空间尺寸满足Odijk条件,从而促使完全凝聚DNA转变为棒状结构;对于恒定半径的情况,临界体积分数反比于形状因子,而恒定长度的情况下,临界体积分数正比于形状因子。
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