环境因素及几何受限对DNA凝聚影响的模拟研究

来源 :贵州师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:camisado
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
DNA分子作为生物界中的重要遗传物质,其性质一直以来都备受关注。目前实验表明,诸如温度、拥挤效应对DNA分子相关性质影响显著。例如,温度升高能够促进DNA凝聚,拥挤效应可以直接导致DNA凝聚。但是温度对DNA凝聚促进作用的机制及拥挤效应对高价反离子导致的DNA凝聚过程影响均有待于进一步认识。鉴于此,利用蒙特卡洛模拟方法,开展以下工作:(1)温度对DNA分子凝聚过程的影响。将温度对DNA分子驻留长度的影响整合到DNA分子凝聚的强关联模型中,探究温度对DNA凝聚单分子实验过程的影响,得到与单分子实验吻合的结果。拉力较小时,DNA发生凝聚过程,随着温度升高DNA凝聚越来越紧凑。(2)在de Gennes和Odijk交叉区域系统地研究了拥挤效应对DNA凝聚过程的影响。利用DNA凝聚强关联模型表征DNA分子,与球状粒子受限于形状因子不同的受限空间,结果表明,拥挤效应显著促进DNA凝聚过程,球形受限的情况下,随着球形粒子体积分数增加,DNA分子由最初的线团状态逐步凝聚为面包圈结构,进一步转变为棒状结构,最后完全凝聚,而且临界体积分数与球形粒子直径呈正比;随着形状因子增加,在胶囊形受限体系中,拥挤效应对DNA凝聚的促进作用较为复杂,一旦形状因子大于1.6,随着体积分数的增加,DNA由完全凝聚状态逐渐转变为棒状结构,主要源于球形粒子重排,导致实际受限空间尺寸满足Odijk条件,从而促使完全凝聚DNA转变为棒状结构;对于恒定半径的情况,临界体积分数反比于形状因子,而恒定长度的情况下,临界体积分数正比于形状因子。
其他文献
从主要形态特征与分布、栖息习性、对盐度和温度的适应、摄食方式与食物组成、生长与繁殖生物学等几个方面,综述了中国淡水主要养殖爬行动物中华鳖Pelodiscus sinensis、乌龟
目的用修订的膳食平衡指数(DBI-07)评价中山市成年居民膳食质量,为其营养指导提供依据。方法用多阶段分层整群随机抽样法,2015年对984名18~65岁居民进行食物频率问卷调查,计
慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease, COPD)是一个重大的公共健康问题,我国每年因COPD死亡的约有100万人,随着社会老龄化,其患病人数随之增加。对其严
RD公司是一家专注于研究、设计、生产及销售移动通信设备中高功率放大器设备(Power Amplifier以下简称“PA”)的美资公司。本文主要以RD公司一款RLPB产品的精益生产项目为案
目的与意义支气管哮喘(bronchial asthma,以下简称哮喘)是肺部慢性炎症性疾病,能影响到各个年龄段的人群。在过去的40年里,全球哮喘患者的发病率、死亡率和所造成的经济负担
随着人民群众生活水平的提高以及社会经济的日渐发展,园林景观的规划也不断的受到社会广泛的重视以及关注,不仅要求园林景观设计要契合自然发展的规律,还要求其遵从生态环境
目的探讨新生儿脑积水的临床病例特点。方法应用儿科住院病历检索系统,检索2013年6月至2018年6月在新生儿科确诊的脑积水患儿,按照胎龄分为早产儿组和足月儿组。共纳入136例
目前,全球面临着资源日益稀缺、环境污染加重的困难,汽车工业作为一种支柱性产业,也受到了相应的影响。为了解决这些问题,各国纷纷探索低污染、低能耗的可替代资源,新能源汽
光纤EFPI传感器由于其自身诸多的优点,可以根据不同的传感机理实现物理、化学、生物参数测量,该传感器对动态信号的稳定解调技术主要分为波长解调法和强度解调法。波长解调动
目的:研究BCG对哮喘大鼠气道炎症及气道高反应性的预防作用,探讨BCG对Th1/Th2平衡的调节及其对血管重塑的影响。方法:清洁级SD大鼠40只(雄性,4周龄,体重50-100克之间),随机分