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目的:探讨川崎病患儿肠道菌群的变化并且评估其与系统炎症的关系。方法:选取2017年4月至2019年1月本院30名急性川崎病患儿作为急性期组,收集粪便及血清标本,并对其进行随访,在川崎病患儿发病后6个月（前后15天内）收集第二份粪便样本,作为非急性期组。另选取30名性别和年龄匹配的健康儿童作为健康对照组,收集其粪便及血清标本。使用16S rRNA测序分析粪便细菌菌群的组成,用流式细胞仪检测血清炎性细胞因子。结果:1.与健康对照组相比,急性期川崎病患儿的粪便细菌多样性明显减少（P<0.05）,粪便细菌丰度在急性期川崎病患儿和健康对照组间没有统计学差异（P>0.05）。2.急性期川崎病患儿的肠球菌属（Enterococcus）、不动杆菌属（Acinetobacter）、螺杆菌属（Helicobacter）、乳球菌属（Lactococcus）、葡萄球菌属（Staphylococcus）和丁酸单胞菌属（Butyricimonas）的相对丰度显著高于健康对照组（LDA>2.0,P<0.05）。3.与健康对照相比,产短链脂肪酸（Short-chain fatty acid,SCFA）的肠道细菌,包括普雷沃菌属（Prevotella）、小杆菌属（Dialister）、梭菌属（Clostridium）、优杆菌属（Eubacterium）、罗氏菌属（Roseburia）和巨型球菌属（Megasphaera）在急性期川崎病患儿中明显减少（LDA>2.0,P<0.05）。与急性期川崎病患儿相比,产SCFA的肠道细菌,包括布劳特氏菌属（Blautia）、普雷沃菌属（Prevotella）、小杆菌属（Dialister）、梭菌属（Clostridium）、罗氏菌属（Roseburia）和瘤胃球菌属（Ruminococcus）在非急性期川崎病患儿中明显富集（LDA>2.0,P<0.05）。4.与健康对照组相比,急性期川崎病患儿的血清炎性细胞因子,包括白介素-2、白介素-4、白介素-6、白介素-10、肿瘤坏死因子-α和干扰素-γ明显升高（P<0.05）。5.肠球菌属（Enterococcus）与白介素-2和白介素-6呈正相关（r=0.39,P=0.01;r=0.39,P=0.02）,螺杆菌属（Helicobacter）与白介素-6呈正相关（r=0.37,P=0.00）,而Clostridiumsensustricto1与肿瘤坏死因子-α呈负相关（r=-0.38,P=0.02）。结论:1.急性期川崎病患儿的肠道微生物多样性明显下降,提示川崎病患儿存在肠道菌群失调。2.急性期川崎病患儿的肠球菌属（Enterococcus）、不动杆菌属（Acinetobacter）、螺杆菌属（Helicobacter）、乳球菌属（Lactococcus）、葡萄球菌属（Staphylococcus）和丁酸单胞菌属（Butyricimonas）的相对丰度显著增高,产短链脂肪酸的肠道细菌相对丰度明显减少,促进了与川崎病相关的肠道菌群失调。3.川崎病肠道菌群紊乱与全身炎症反应相关,为川崎病的病因学研究提供了新的思路,有助于更好地了解其发病机制。