DNA提取是开展分子生物学实验研究的基础步骤,提取通量和质量直接影响后续实验能否顺利实施。近年来,随着棉花基因组学研究的不断深入,棉花生物技术得到了快速发展和应用,同时对棉花基因组DNA提取效率与质量也提出了更高的要求。目前常用的DNA提取方法大多无法同时兼顾提取通量和质量。本试验通过综合分析影响DNA提取质量的多种因素、筛选新型表面活性剂、改良DNA提取液配方,突破高通量DNA提取浓度与质量难以兼顾的核心问题,建立了棉花高通量DNA提取方法,并应用于98份冀审棉标准样品的DNA指纹图谱构建。本论文形成如下研究结果:1.通过对比DNA浓度与OD260/280值,分别确定样品前处理方法、取样时期、取样组织、样品棉酚含量以及不同DNA提取方法对棉花DNA提取效果的影响。结果发现样品前处理方法、取样时期、取样组织和DNA提取方法均与DNA提取效果有显著相关性。2.通过在裂解液中加入APG、LAS、CPB、DTAB、Tween80、SDS和CTAB 7种不同表面活性剂,对比7种表面活性剂在棉花种子和叶片的DNA提取效果。发现提取过程中LAS提取液和CTAB提取液均能得到明显的大块絮状沉淀,并可完全溶解。并且LAS提取种子和叶片浓度纯度最好,CTAB次之。3.进一步将LAS表面活性剂与磁珠纯化DNA和氯仿抽提法纯化DNA两种纯化方式的高通量DNA提取方法结合,将传统SDS和CTAB提取液作为对照,对比DNA提取浓度与质量。结果表明高通量LAS法提取种子和叶片效果较好。LAS高通量DNA提取方法,通量可达到每2 h提取400个样品,高于LAS磁珠法通量。这表明LAS表面活性剂与氯仿抽提法纯化方法相结合能够同时兼顾DNA提取通量与质量,并能满足大部分的分子实验要求。4.利用LAS高通量DNA提取方法提取98个河北审定棉花标椎样品的DNA,DNA提取效果良好,参照实验室前期制定的农业行业标准《棉花品种真实性鉴定SSR分子标记法》,采用60对核心SSR引物构建98份河北审定棉花标椎样品的指纹图谱。98份样品可达到100%清晰分型,峰型尖锐无杂峰。本研究为河北棉花品种审定、保护和市场监管提供了重要的参考价值。