农民专业合作组织在增加农民收入、提高农户进入市场的组织化程度以及推进我国农业产业化经营中发挥了重要的作用。农民专业合作经济组织的良性发展应该以充分尊重农民的意愿为前提,并且以满足农民的发展为根本目的。因此了解农户加入农民专业合作经济组织的意愿,从理论视角解析农户加入农民专业合作组织的影响因素,以及对农户内部合作机制进行探讨,理清构建长效农户合作机制的思路,对促进我国农民专业合作组织的健康发展具有重要的意义。本文运用交易成本理论从交易主客体特征、交易特性和外部环境特征出发,对影响农户加入农民专业合作社的因素进行了系统的梳理,并运用logistic模型对影响农民参与合作社的因素进行了实证分析,研究结果显示社会关系网络资源、金融资本、年龄、农产品特性和社会阅历对于农户加入农民专业合作经济组织具有显著影响。在此基础上,论文以湖南望城乌山贡米合作社为案例,进一步对合作组织内部的合作机制进行了深入的剖析,研究表明农户合作机制在节约交易费用、形成统一品牌推动产业发展、增强参合农户收入、提高人力资本方面具有十分重要的作用。文章最后指出政府要扩大对合作社的扶持力度,积极引导农户参合,并且不断完善金融体系,拓宽农户融资渠道,加大对农产品的各方位支持,规范合作社内部的运行机制和组织治理机制,从而提高合作社的竞争力。