随着经济社会的快速发展,小微企业这一群体发挥着越来越重要的作用。一方面,它在很大程度上促进国民经济增长,为经济发展注入活力,另一方面,从社会角度来看,小微企业的稳定发展,为国家解决了就业难题。近年来,中共中央重视小微企业发展,为小微企业提供较多的政策支持,其中在小微企业减税降费方面的税收政策优惠力度非常大。然而税务机关长期关注小微企业是否享有优惠,忽视税源管理致使小微企业所得税税收流失一直存在。本文以S县税务局的管理现状出发,分析近三年来企业所得税汇算清缴数据和风险管理数据,并通过一户典型的长亏不倒企业作为案例,深入分析小微企业企业所得税管理存在的问题。通过数据分析法、案例分析法,深入挖掘和分析S县小微企业企业所得税管理缺失和原因,对S县小微企业企业所得税管理提出对策建议。研究成果是在于剖析S县小微企业企业所得税管理存在的深层次问题,税务机关日常管理缺位、税务人员素质不强、税务机关内控机制不健全、风险管理体系不精准等问题,并从委托代理理论和二八定律分析了税务机关行为和税务人员行为的深层次原因。最后从日常管理和风险管理两方面,对小微企业所得税管理提出对策建议。合理核定小微企业所得税,提高征管质效减少税源流失。增强小微企业信用管理、借助代账机构有针对性的加强会计信息质量,可以促使企业从自身规范会计核算,提高税法遵从。完善税务人员监督管理机制、健全税务人员激励培养机制,提升干事创业激情。从风险管理角度来看,在政策制度方面制定小微企业税收风险管理办法,在机构设置上强化小微企业风险管理独立性,在整合体系方面加快融合原国地税风险管理模式,在指标建设上要合理设置并不断修正。本文的应用价值在于:提升S县税务局管理能力,提高征管质效,减少税源流失。S县以制造业为主要税收来源的三线城市,本文中的典型案例和对策建议可以对以制造业为主的地区提供管理上的借鉴意义。同时人力资源不足是县级基层税务机关的共性,激励和监督手段的建议可以对内部机构管理提供参考。